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快速检测球孢子菌属DNA,首选方法
球孢子菌病的辅助诊断
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球孢子菌病是由二形真菌引起的,球孢子菌属巨细胞和球孢子菌属posadasii。这些生物是美国西南部地区、墨西哥北部以及中美洲和南美洲地区特有的。这种疾病通常表现为自限性上呼吸道感染,(1)临床发病一般发生在吸入球虫孢子(关节孢子)后10 - 16天。(2)既往健康或免疫抑制的个体,疾病进展可能迅速。
目前,球孢子菌病诊断的金标准是临床标本的培养。(3)然而,在培养过程中生长可能需要数周的时间。这往往会延误对感染者的诊断和治疗。此外,繁殖球孢子菌属对实验室人员来说,物种是一个重大的安全危害,如果该微生物不能迅速识别和适当处理(即在生物安全3级设施中),就会成为实验室获得性感染的一个重要原因。血清学试验包括免疫扩散试验和补体固定试验被广泛应用于抗体检测球孢子菌属.血清学的球孢子菌属可能受到抗体发展延迟或与其他真菌交叉反应导致的非特异性的限制。此外,免疫扩散和补体固定试验是高劳动强度的,通常限于参考实验室。
分子方法可以识别球孢子菌属物种直接从临床标本,允许更快速的诊断。还应进行真菌培养,因为分离物可能需要进行抗真菌药敏试验。
不适用
阳性结果表明存在球孢子菌属DNA。
阴性结果表明没有检测到球孢子菌属DNA。
此试验应与真菌培养一起进行。
这种快速PCR方法检测球孢子菌属因此,不区分活的、与疾病相关的生物体和短暂的定殖生物体或从旧疾病持续存在的核酸。检测结果应与患者症状和临床表现相关,然后作出明确诊断。
阴性结果也不能排除球孢子菌属或活动性疾病,因为该生物体的存在水平可能低于本试验的检测限度。
这个测试不区分球孢子菌属巨细胞和球孢子菌属posadasii。
对266例呼吸道标本(支气管肺泡灌洗、痰液、诱导痰、支气管洗液、胸膜液)进行LightCycler PCR分析球孢子菌属菌种检测灵敏度为100%,特异性为98.4%。对66份新鲜组织标本进行分析,敏感性为92.9%,特异性为98.1%。对148份石蜡包埋组织标本进行检测,灵敏度为73.4%,特异性为100%。
检测限为1 ~ 10拷贝靶/微升(<50拷贝靶/反应)。通过在国家生物技术信息中心网站(http://www.ncbi.nml.nig.gov)上使用基本局部比对搜索工具(BLAST)对引物和探针序列进行搜索,确定了分析的特异性。此外,从114个可能产生交叉反应的生物体中提取的大量核酸进行了检测,这些生物体包括真菌、细菌、分枝杆菌、病毒和人类DNA。该分析没有显示与特异性面板中包含的任何生物体的交叉反应。
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