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该方法采用实时聚合酶链反应(PCR)在LightCycler 480平台上进行结核分枝杆菌配合物特异性引物结合荧光共振能量转移(FRET)探针,在物种水平上区分配合物的成员。探针的目标区域的特定差异(RD)M肺结核复杂的基因组。检测这些RD的存在或不存在允许在物种内部的分化M肺结核复杂。(Halse TA, Escuyer VE, Musser KA:评价单管多重实时PCR对分化的影响M肺结核复杂的临床标本。J clinical Microbiol. 2011;49:2562-2567)
对每个物种的期望M肺结核复合体如下表所示。“+”表示该区域存在,“-”表示该区域不在。
期望的RD签名模式 |
RD1 |
RD4 |
RD9 |
RD12 |
RD9-2 |
结核分枝杆菌 |
+ |
+ |
+ |
+ |
+ |
牛结核分枝杆菌 |
+ |
- |
- |
- |
+ |
牛结核分枝杆菌卡介苗 |
- |
- |
- |
- |
+ |
分枝杆菌africanum |
+ |
+ |
- |
+ |
+ |
分枝杆菌canettii |
+ |
+ |
+ |
- |
+ |
分枝杆菌caprae |
+ |
+ |
- |
- |
+ |
分枝杆菌microti |
- |
+ |
- |
+ |
+ |
分枝杆菌mungi |
+ |
+ |
- |
+ |
+ |
分枝杆菌pinnepedii |
+ |
+ |
- |
- |
+ |
星期一到星期五