测试ID: CFTRZ
雌性生殖道基因，全基因分析，变化

随访检测以确定临床诊断为囊性纤维化(CF)的个体中的突变，并对常见突变进行靶向突变分析为阴性

鉴别CF不典型表现个体的突变(如先天性双侧输精管缺失或胰腺炎)

在个体中识别突变，目标突变分析检出率低或未知的种族背景

鉴别囊性纤维化跨膜电导调节剂可能有反应的患者(雌性生殖道)增效剂治疗

这是不作为载体筛查或初步诊断的首选基因检测。对于这些情况，订购CFP /囊性纤维化突变分析，106-突变面板，变化

这种检测不是首选的载体筛选或诊断的一级分子检测。当CFP /囊性纤维化突变分析(106-突变面板)为阴性或无信息时，它用于识别临床诊断为囊性纤维化(CF)的个体的突变。

该测试包括下一代测序，以评估突变雌性生殖道基因。桑格测序可用于确认检测到的变异。

看到囊性纤维化分子诊断检测算法参阅特别说明以了解更多信息。

囊性纤维化(Cystic fibrosis, CF)是一种严重的常染色体隐性遗传疾病，以不同程度的慢性阻塞性肺疾病和胰腺酶功能不全为特征。临床诊断通常基于这些特征，并结合汗液氯化物试验阳性或鼻电位差阳性。CF也有不典型的表现，可能表现为先天性双侧输精管缺如(CBAVD)、慢性特发性胰腺炎、支气管扩张或慢性鼻-鼻窦炎。几个州已经实施了新生儿CF筛查，通过测量在滤纸上采集的干燥血液样本中的免疫反应性胰蛋白酶原来识别可能受影响的个体。

如果临床诊断为CF，则可用分子检测常见CF突变。迄今为止，CF基因中已经描述了超过1500个突变，命名为囊性纤维化跨膜电导调节器(雌性生殖道)．最常见的突变是deltaF508，约占全球变异的67%，在北美高加索人群中约占70%至75%。大多数剩余的突变是相当罕见的，尽管有些在某些民族或某些非典型CF表现(如孤立CBAVD)中表现出相对较高的患病率。

确定CF诊断或检测带菌者状态的推荐方法首先对常见CF突变进行分子检测(如CFP /囊性纤维化突变分析，106突变面板，各不相同)。这个测试,雌性生殖道基因，全基因分析，如果一个或两个致病突变没有被目标突变分析检测到，变化可能被排序。全基因分析，通过测序和剂量分析雌性生殖道基因，用于检测私人突变。一起，完整的基因分析雌性生殖道基因和缺失/重复分析鉴定了98%以上的序列变异在编码区域和剪接连接。

值得注意的是，FDA指南指出CFTR增强剂或联合化学伴侣/增强剂疗法可能改善临床诊断为CF且至少有1个小突变子集的患者的临床结果。如果发现与fda批准的治疗相关的突变之一，该信息将包括在解释报告中。

看到囊性纤维化分子诊断检测算法参阅特别说明以了解更多信息。

将提供一份解释性报告。

根据美国医学遗传学和基因组学学院(ACMG)的建议，对所有检测到的变异进行评估。(1)根据已知、预测或可能的致病性对变异进行分类，并报告解释性评论，详细说明它们的潜在或已知意义。

一小部分被诊断为囊性纤维化(CF)的个体可能存在该方法无法识别的突变(如启动子突变、深度内含子改变)。因此，没有突变并不排除阳性携带者状态或CF诊断的可能性。对于携带者检测，首先证明囊性纤维化跨膜电导调节因子(雌性生殖道)受影响家庭成员的基因突变。

检测结果应结合临床表现、家族史和其他实验室数据进行解释。如果给出的信息不准确或不完整，我们对结果的解释可能会出现错误。

技术的局限性:

在某些情况下，可以鉴定出意义不明的DNA变异。

存在可能导致假阴性或假阳性结果的罕见多态性。如果获得的结果与临床结果不一致，则应考虑进行额外的检测。

除了与疾病相关的探针，多重连接依赖的探针扩增技术利用定位于染色体其他区域的探针作为内部控制。在某些情况下，这些控制探头可能会检测到本试验没有专门针对的其他疾病或条件。通常不报告控制探针的结果。然而，在临床相关信息被确定的情况下，将通知订购医生结果，并提供任何适当的后续检测建议。

评估工具:

多种硅质评价工具被用于帮助解释这些结果。这些工具定期更新;因此，对这些算法的更改可能导致对给定更改的不同预测。此外，这些工具用于确定致病性的可预测性目前尚未得到验证。

除非有报告或预测会引起疾病，否则不会导致氨基酸替代的蛋白质编码基因的改变没有报道。这些和为该患者识别的常见多态性可根据要求提供。

Variants-Policy重新分类:

根据美国医学遗传学和基因组学学院的建议，对所有检测到的变化进行评估。变异是根据已知的、预测的或可能的致病性进行分类的，并以解释性注释详细说明其潜在的或已知的意义。目前，实验室系统地审查以前已发现和报告的可能的致病改变或意义不确定的变异还不是标准做法。实验室鼓励卫生保健提供者随时与实验室联系，以了解某一特定变体的状态随时间的变化情况。

1.Richards S, Aziz N, Bale S，等:解释序列变异的标准和指南:美国医学遗传学和基因组学学院和分子病理学协会的联合共识建议。Genet Med 2015 May;17(5):405-424

2.囊性纤维化。柳叶刀1998年1月24日;351(9098):277-282

3.囊性纤维化跨膜调节基因的广泛测序:检测验证和开发一个综合测试的意外好处。Genet Med 2003 1 - feb;5(1):9-14

4.De Boeck K, Munck A, Walker S，等:ivacaftor在囊性纤维化和G551D门控突变患者中的有效性和安全性。J囊肿纤维2014年12月;13(6):674-680 doi: 10.1016/j.jcf.2014.09.005

5.cyril RJ, Sciortino S, Liu R，等:基因组测序在新生儿囊性纤维化筛查中的作用:两层预先定义的CFTR突变面板还是第二层CFTR面板接着第三层测序?Genet Med 2017 Oct;19(10):1159-1163

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