测试ID: HCRC
遗传性结肠癌多基因图谱，各不相同

对有遗传性结肠癌综合征的个人或家族病史的患者提供遗传性结肠癌的综合评估

用于既往针对特定遗传性结直肠癌相关基因的靶向基因变异分析为阴性的患者的二级检测

在某些情况下建立遗传性结肠癌综合征的诊断，允许对已知有较高癌症风险的相关结肠外器官进行靶向癌症监测

识别已知与结肠癌风险增加相关的基因变异，允许对有风险的家庭成员进行预测性检测

该测试包括下一代测序、Sanger测序、阵列比较基因组杂交和多重连接依赖的探针扩增，以评估面板上列出的基因。

之前的授权可用于本分析;看到特殊指令

看到遗传性结肠癌研究小组的靶向基因区域详细信息请参阅本试验所鉴定的靶向基因区域。

以下算法可在特殊说明:

-林奇综合症测试算法

-结肠息肉病综合征检测算法

结直肠癌发生在一般人群中大约5%到6%的个体。在极少数情况下，有结肠直肠癌家族史的个体，由于单基因易感性综合征(即遗传性结肠直肠癌)，患结肠和其他癌症的风险可能会增加。2种最常见的遗传性结直肠癌综合征是林奇综合征和家族性腺瘤性息肉病(FAP)。然而，还有许多其他基因也被认为会导致遗传性结直肠癌或增加结直肠癌的风险。该小组使用下一代测序(NGS)、阵列比较基因组杂交(aCGH)和其他技术来评估已知与结肠癌发展风险增加相关的17个基因的种系变异。列出的两个基因，CHEK2和MLH3它与已知的遗传性癌症综合征(由不同的肿瘤谱系定义)没有关联。然而，文献表明，这些基因的变异可能会增加结肠癌的风险，因此，预计会增加患者和家庭的癌症风险。

检测适应症包括但不限于:

-没有明显的特定结肠直肠癌综合征，但有明确家族成分的患者

-家族病史与家族性X型大肠癌一致的患者(1)

-根据家族中常染色体显性遗传模式，对单基因遗传性结肠癌综合征有强烈怀疑的患者

-有结肠息肉病个人或家族病史的患者

将提供一份解释性报告。

根据美国医学遗传学和基因组学学院的建议，对所有检测到的变异进行评估。(2)根据已知、预测或可能的致病性对变异进行分类，并报告解释性评论，详细说明它们的潜在或已知意义。

临床相关性:

一些参与了面板上1个或更多基因的个体可能有一种不能被所执行的方法识别的变异(例如，启动子改变，深度内含子改变)。因此，变异的缺失并不能排除遗传性结直肠癌综合征或其他遗传性结肠癌风险的可能性。对于无症状个体的预测检测，首先证明在受影响的家庭成员中存在基因变异是很重要的。

检测结果应结合临床表现、家族史和其他实验室数据进行解释。如果提供的信息不准确或不完整，可能会导致对结果的误解。

技术的局限性:

在某些情况下，可以鉴定出意义不明的DNA变异。

由于下一代测序的局限性，长度大于8个核苷酸的小缺失和插入将不会被该测试检测到。如果该小组对其中一种综合征的诊断仍有怀疑，考虑使用传统的桑格方法进行全基因测序。通过阵列比较基因组杂交(aCGH)检测单个或多个外显子缺失以及全基因缺失。

存在可能导致假阴性或假阳性结果的罕见变化。如果获得的结果与临床结果不一致，则应考虑进行额外的检测。

除了与疾病相关的探针，多重连接依赖的探针扩增技术利用定位于染色体其他区域的探针作为内部控制。在某些情况下，这些控制探头可能会检测到本试验没有专门针对的其他疾病或条件。通常不报告控制探针的结果。然而，在临床相关信息被确定的情况下，将通知订购医生结果，并提供任何适当的后续检测建议。

评估工具:

多种硅质评价工具被用于帮助解释这些结果。这些工具定期更新;因此，对这些算法的更改可能导致对给定更改的不同预测。此外，这些工具在确定致病性方面的可预测性目前还没有得到验证。

除非报道或预测会引起疾病，否则未报道内含子深部的改变或不会导致氨基酸取代的改变。这些和为该患者确定的常见改变可根据要求提供。

Variants-Policy重新分类:

目前，实验室系统地审查检测和报告的可能有害的改变或意义不确定的变体还不是标准做法。实验室鼓励卫生保健提供者随时与实验室联系，以了解某一特定变体的状态随时间的变化情况。

1.Lindor NM, Rabe K, Petersen GM，等:阿姆斯特丹- i标准家庭中无错配修复缺陷的低癌症发生率:家族性结直肠癌x型JAMA。2005; 293 (16): 1979 - 1985

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3.Lindor NM, McMaster ML, Lindor CJ, Greene MH，国家癌症研究所，癌症预防部门，社区肿瘤和预防试验研究组:家族性癌症易感性综合征简明手册第二版。中国癌症杂志，2008;(38):1-93

4.Masciari S, Syngal S:角色p53在结肠直肠癌。In: Potter JD, linor NM, eds。大肠癌的遗传学。施普林格-;2009:213 - 217

5.Jaeger E, Leedham S, Lewis A，等:遗传性混合息肉病综合征是由40 kb的上游复制导致BMP拮抗剂的增加和异位表达引起的GREM1．Nat麝猫。2012;44 (6):699 - 703

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7.Lammi L, Arte S, Somer M，等:突变AXIN2导致家族性牙齿发育不全，易患结直肠癌。Am J Hum Genet 2004;74:1043-1050

8.刘红霞，周晓莉，刘涛，等:hMLH3在家族性结直肠癌中的作用。实用癌症杂志2003;63 (8):1894 - 1899

• 分子遗传学:遗传性癌症综合征患者信息
• 基因检测的知情同意
• 结肠息肉病综合征检测算法
• 遗传性结肠癌多基因面板预先授权订购说明
• 遗传性结肠癌研究小组的靶向基因
• 林奇综合症测试算法
• 基因检测的知情同意(西班牙语)