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测试ID:HCRC
遗传性结肠癌多基因面板,变化

方法描述介绍如何执行测试并提供特定于方法的参考

下一代测序和/或桑格测序的执行是为了测试是否存在变异APCAXIN2.bmpr1a.CDH1Chek2.MLH1.MLH3.MSH2MSH6myh./MutYHTP53PTEN.(包括促进者的分析),Smad4., 和STK11.基因。另外,阵列对比基因组杂交(ACGH)用于测试大缺失和重复的情况APC(包括启动子1A和1B的分析),AXIN2.bmpr1a.CDH1Chek2.(不包括外显子12-15),EPCAM.MLH1.MLH3.MSH2MSH6,TP53PTEN.Smad4., 和STK11.基因。此外,ACGH用于测试3'末端的大缺失和重复的存在。ECAPM.基因并评估报告的40 kB重复情况SCG5 / GREM1。(Pritchard CC,Smith C,Salipante SJ等:Coloseq使用大规模平行测序提供综合的林基和息肉综合征突变分析。J Mol Diagne。2012; 14 [4]:357-366;阿拉多拉S,Lewis R,邦戈T,等:大型临床队列中的外显子级阵列CGH表明了孟德尔疾病诊断测试的敏感性。Genet Med。2012; 14 [6]:594-603)

使用远程聚合酶链反应(PCR)进行双向序列分析,以测试在所有编码区和内含子/外显子/外界中存在变体的存在PMS2.基因。通过多重连接依赖性探针扩增的基因剂量分析用于测试大量缺失和重复PMS2.基因。(Clendenning M,Hampel H,Lajeunesse J,等:远程PCR促进了鉴定PMS2.特异性突变。嗡嗡声。2006; 27 [5]:490-495;Vaughn Cp,Hart KJ,Samowitz Ws,Swensen JJ:避免在检测3'删除中的伪粘面干扰PMS2.。嗡嗡声。2011; 32:1063-1071)

使用Sanger测序或其他基于PCR的测定来确认通过下一代测序检测的所有报告的改变。

PDF报告指示报告是否包括具有图表,图像或其他丰富信息的附加文档

没有

日期概述测试执行的日子。该领域反映了样品必须在测试实验室开始测试过程的那一天,并在进行测试之前包括任何样本准备和处理时间。一些测试被列为连续进行,这意味着在白天多次进行测定。

每周表演

报告可用时间间隔(在Mayo诊所实验室收到样品,以获得标准设置天和周末的结果)。yabo208第一天是它通常需要的时间是可用的。最后一天是可能需要的时间,占任何必要的重复测试。

4到5周

标本保留时间概述测试后标本在实验室中保存的时间,然后将其丢弃

全血:2周(如果可用)提取DNA:无限期

执行实验室位置表明执行测试的实验室的位置

罗切斯特