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测试ID: HPFRP
幽门螺杆菌克拉霉素耐药预测,分子检测,PCR,粪便

有用的建议临床疾病或测试可能有帮助的环境

帮助诊断幽门螺杆菌直接从粪便中预测克拉霉素耐药或易感性的感染

测试算法描述将测试添加到初始顺序时的情况。这包括反射和其他测试。

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临床信息讨论生理学,病理生理学和一般的临床方面,因为他们涉及一个实验室测试

幽门螺杆菌是消化性溃疡的主要原因,如果不加以治疗,则是胃癌的危险因素。传统上,H幽门诊断包括非侵入性试验(如尿素呼气试验、粪便抗原试验)或侵入性试验(如胃活检)。抗菌素耐药性的H幽门虽未得到充分研究,但仍在上升,对其治疗提出了挑战;临床财团在2012年,一个国际研究小组建议监测克拉霉素的耐药性利率和停止其使用在阈值范围的15%到20%。(1)当地监控几乎已经不可能不是所有的病人接受侵入性测试,产生了文化隔离,可以进行敏感性测试。即使进行了侵入性检测,这种微生物也很难在培养中分离出来,而且一旦分离出来就非常苛刻,通常不适合进行表型易感性检测。此外,只有少数专业微生物实验室执行H幽门敏感性测试。2016年发表的一项针对当地和参考菌株的内部研究发现,克拉霉素耐药最常见的原因是A2143G(70/88株,79.6%),其次是A2142G(12/88株,13.6%)和A2142C(3/88株,3.4%)23S核糖体RNA基因改变。其中一种改变在97%的克拉霉素耐药人群中被发现H幽门分离的研究。

参考价值描述用于解释测试结果的参考间隔和附加信息。可能包括基于年龄和性别的间隔时间。间隔是mayo派生的,除非另有指定。如果提供了解释性报告,参考值字段将说明这一点。

没有检测到

解释提供有助于解释测试结果的信息

检测到的结果表明存在幽门螺杆菌23S核糖体RNA基因;是否检测到与克拉霉素耐药相关的3种最常见的23S核糖体RNA基因单核苷酸变异(A2143G、A2142G和A2142C)。

未检测到的结果H幽门表示没有检测到H幽门DNA,但不否定生物体的存在,可能发生由于抑制聚合酶链反应(PCR),序列变异的潜在引物或探针,或存在H幽门DNA的数量低于本试验的检测限度。

注意事项讨论可能导致诊断混乱的条件,包括不适当的标本采集和处理,不适当的试验选择和干扰物质

在试验前至少2周应避免使用铋化合物、抗生素和抑酸药物(组胺h2受体拮抗剂和质子泵抑制剂),因为这些药物可能导致假阴性的试验结果,因为这些药物可能具有潜在的活性幽门螺杆菌

检测结果应作为诊断的辅助手段。单一检测不应作为形成治疗决定的唯一标准;这项检查的结果应与临床表现和其他实验室检查的结果相关联。阴性结果不能否定有机体或活动性疾病的存在。

下列非幽门螺杆菌可能发生潜在的交叉反应幽门螺杆菌物种:无爪幽门螺杆菌,鲸状幽门螺杆菌,幽门螺杆菌mustalae(未被报道会引起人类疾病)和犬幽门螺杆菌,cinaedi幽门螺杆菌,bizzozeronii幽门螺杆菌heilmannii(很少在人类身上发现)。

本试验检测与克拉霉素耐药相关的三种最常见的23S核糖体RNA单点变异。没有评估克拉霉素耐药的其他机制,也没有评估对非克拉霉素抗菌剂的耐药机制。

支持数据

在实验室验证研究中,745份粪便样本之前曾用子午线Premier铂HpSA Plus粪便抗原测试进行了测试。分析检测到幽门螺杆菌306/335抗原阳性粪便样本的DNA(敏感度为91% [87.5-93.9%,95% CI])。的幽门螺杆菌用克拉霉素耐药预测(HPFRP)法检测H幽门在12/410份抗原阴性的粪便样本中检测到DNA(97.1%特异性[94.9%-98.5%,95% CI])。阳性预测值和阴性预测值分别为96.2% (93.5 ~ 98.0%,95% CI)和93.0% (90.1 ~ 95.2%,95% CI)。简单Kappa系数测定的性能,该试验与抗原试验的性能是0.89 (0.85-0.92,95%CI),几乎完全相关。

通过对所有hfrp阳性样本进行双向Sanger测序,评估克拉霉素耐药预测。76个样本均预测克拉霉素易感H幽门,在2142和2143位显示野生型23S核糖体RNA基因序列。所有的37个样本都预测有克拉霉素耐药性,幽门A2143G、A2142G、A2142C的单核苷酸多态性H幽门23S核糖体RNA基因。

临床参考临床性质的深入阅读的建议

1.王志强,王志强,王志强,等幽门螺杆菌《马斯特里赫特四世/佛罗伦萨共识报告》。61(5):646-664 doi: 10.1136/gutjnl-2012-302084

2.陈德华,陈德华,陈德华,陈德华幽门螺杆菌。抗微生物药物化学。2017年3月24日;61(4):e02530-16

3.Landis JR, Koch GG:分类数据的观察者一致性度量。生物识别技术1977;33:159 - 174

4.Beckman E, Saracino I, Fiorini G,等:一种新的粪便PCR检测幽门螺杆菌可以预测克拉霉素的耐药和高感染率的根除。J clinical Microbiol. 2017 Aug;55:2400-2405

5.Monteiero L, Gras N, Vidal R, Cabrita J, Megraud F:检测幽门螺杆菌PCR检测人类粪便中的DNA: DNA稳定性和抑制剂的去除。微生物学方法。2001 6月;45(2):89-94。doi: 10.1016 / s0167 - 7012 (01) 00225 - 1

6.Marrero Rolon R, Cunningham SA, Mandrekar JN, Polo ET, Patel R:从粪便中同时检测幽门螺杆菌和克拉霉素耐药基因型标记物的临床评价。5 (5):e03040-20。doi: 10.1128 / JCM.03040-20

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