测试ID：PDGP
过氧化血障碍基因面板，变化

伴有异常生化结果，通常是非常长的脂肪酸试验与过氧异甲酸敏感症一致

对过氧化合物体紊乱患者建立分子诊断

鉴定已知与过氧异相疾病相关的基因内的变体，允许预测风险的家庭成员

该测试利用下一代测序来检测与过氧甲基异甲型病症相关的28个基因中的单核苷酸和拷贝数变体：ABCD1，ABCD3，ACOX1，ACOX3，AGPS，AMACR，CAT，DNM1L，GNPAT，HSD17B4，PEX1，PEX10，PEX11B，PEX12，PEX13，PEX14，PEX16，PEX19，PEX2，PEX26，PEX3，PEX5，PEX6，PEX7，PHYH，PHYH，PHYHSCP2，SUGCT，TRIM37。请参阅方法描述以获取其他详细信息。

鉴定致病变异可有助于诊断，预后，临床管理，家族性筛查和过氧化血障碍的遗传咨询。

可以考虑额外的第一层测试/推荐。有关更多信息，请参阅咨询信息。

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过氧化血剂负责细胞的分解代谢作用，包括对非常长链脂肪酸的β氧化，以及代谢作用，包括胆汁酸和疟原虫的生物合成。过氧化血紊乱可以基于破坏的功能分为2个主要基团：过氧化物体生物发生疾病和单氧化酶酶肉酶缺陷。

过氧化物体生物发生障碍是由细胞器的缺陷组装引起的，导致一定量的缺乏函数过氧物质。疾病的严重程度依赖于剩余功能性过氧缺体的量。过氧化物血胺生物发生疾病包括Zellweger谱的那些：Zellweger综合征，新生儿肾上腺胁迫和婴儿refsum疾病。临床特征通常是进行性的，包括发育延迟，肝病，失明和耳聋。严重程度与Zellweger综合征变量是最严重和婴儿的Refsum病是最不严重的。

这些是由于变体PEX.负责编码过氧化物组件的蛋白质的基因。

过氧化物酶酶缺陷导致过氧异相体函数中断，尽管细胞器保持完整。最常见的过氧硅酸异甲型疾病X键肾上腺抑制作宜，是由于变异性的酶缺乏ABCD1.基因。其他酶缺陷包括根瘤菌软骨细胞型型2和3型，先天性胆汁酸合成缺陷。

该面板包括与过氧化合物体生物发生疾病和酶缺陷有关的30个基因的测序。

将提供解释性报告。

所有检测到的改变都根据美国医学遗传学和基因组学（ACMG）建议进行评估。（1）变体基于已知，预测或可能的致病性分类，并报告具有细节其潜在或已知意义的解释性评论。

临床相关性：

测试结果应在临床调查结果，家族史和其他实验室数据的背景下解释。如果提供的信息不准确或不完整，则可能会出现对结果的误解。

如果由于临床上的家庭历史而进行测试，首先测试受影响的家庭成员通常有用。检测受影响的家庭成员中的可报告变体将允许对风险个人进行更丰富的测试。

要讨论进一步测试选项的可用性，有关一般测试选择的帮助，或在解释这些结果的帮助下，可以在800-533-1710联系梅奥诊所实验室遗传辅导员。

技术限制：

下一代测序可能无法检测所有类型的基因组变体。在极少数情况下，可能发生假阴性或假阳性结果。对于某些目标区域，覆盖的深度可以是可变的，但是将注意到测量性能低于最小可接受标准或失败的区域。鉴于这些限制，阴性结果不排除遗传症的诊断。如果怀疑特定的临床疾病，则可以考虑通过替代方法的评估。

如果患者具有同种异体造血干细胞移植或最近的异源输血，则由于供体DNA的存在，这些结果可能是不准确的。致电Mayyabo208o Clinic Laboratories，用于测试接受骨髓移植的患者的说明。

可能存在由于测定的技术限制而无法有效地扩增的基因区域，用于测序或缺失和重复分析，包括同源性，高鸟嘌呤 - 胞嘧啶（GC）含量和重复序列的区域。选择选择可报告变体的确认将由基于内部实验室标准的替代方法进行。

该测定不会可靠地检测40或更多碱基对（BP）的插入/缺失（吲哚），包括ALU插入，长三个核心元素（线），以及短的穿插核心元素（锡）。验证生物信息学软件管道，以检测高达75 BP的95％的删除，也可以插入47 bp。

另外，可能无法检测到低水平的马赛克变体。

该测试不设计用于区分体细胞和种系变体。如果有可能任何检测到的变体是体细胞的，则可能需要额外的测试来澄清结果的意义。

重新分类变体 - 政策：

此时，实验室没有规则地审查先前分类的变体的标准做法。实验室鼓励医疗保健提供者随时与实验室联系，以了解特定变体的地位如何随时间变化。

变体评估：

使用公开的美国医学遗传学和基因组学（ACMG）和分子病理学协会（AMP）建议作为指导方案进行评估和分类。（1）其他基因也可以考虑其他基因。基于已知的，预测或可能的致病性分类变体，并报告了细节其潜在或已知意义的解释性评论。没有报告分类为良性或可能良性的变体。

硅评估工具中的多个可用于帮助解释这些结果。在Silico评估工具中的预测准确性高度依赖于给定基因可用的数据，并且对这些工具的定期更新可能导致预测随时间变化。来自Silico评估工具的结果应谨慎和专业的临床判断解释。没有报道未预测剪接或以其他方式有助于疾病的内含内序列变体。

1. Richards S，Aziz N，Bale S等人：解释序列变体的标准和准则：美国医学遗传学和基因组学和分子病理学协会的联合共识建议。Genet Med。2015年5月; 17（5）：405-424

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