测试ID: 3 mgap
3-甲基谷氨酸酸尿图，变化

随访生化异常提示3-甲基戊二酸尿

建立3-甲基戊二酸尿患者的分子诊断

识别已知与3-甲基谷氨酸酸尿相关的基因变异，允许对有风险的家庭成员进行预测测试

该测试利用下一代测序来检测与3-甲基谷氨酸酸尿相关的17个基因的单核苷酸和拷贝数变异:Agk, atp5f1e, atpa2, auh, clpb, cps1, dnnajc19, gfer, hmgcl, htra2, opa3, polg, serac1, sucla2, taz, timm50, tmem70．看到3-甲基谷酰胺酸尿检测的靶向基因和方法详细信息详见特殊说明和方法说明。

致病变异的鉴定可能有助于3-甲基谷氨酸酸尿症的诊断、预后、临床管理、家族筛查和遗传咨询。

可能会考虑/建议进行额外的一级检测。有关更多信息，请参见订购指南。

3-甲基谷氨酸酸尿症(3-MGA)是一组异质性代谢疾病，其特征是尿液中3-MGA的排泄增加。原发性3-MGA I型是一种有机酸尿，由3-甲基谷氨酰基辅酶a水合酶(AUH)变异引起的亮氨酸分解代谢缺陷引起。还描述了另外四种3-MGA类型，其中3-MGA是一致的特征。这些症状的特征是不同程度的线粒体功能障碍，与亮氨酸降解有关，即使有，也非常遥远，包括Barth综合征(II型)、Costeff综合征(III型)和V型或扩张性心肌病伴共济失调(DCMA)综合征。其余3-MGA增加的病例(IV型)包括多种影响线粒体功能的疾病。已知与3-MGA升高相关的基因也包括在这张面板中。

将提供一份解释性报告。

根据美国医学遗传学和基因组学学院(ACMG)的建议，对所有检测到的变异进行评估。(1)根据已知、预测或可能的致病性对变异进行分类，并报告解释性评论，详细说明它们的潜在或已知意义。

临床相关性:

检测结果应结合临床表现、家族史和其他实验室数据进行解释。如果提供的信息不准确或不完整，可能会导致对结果的误解。

如果检查是由于有临床意义的家族史而进行的，那么首先检查受影响的家庭成员往往是有用的。在受影响的家庭成员中发现可报告的变异将有助于对危险个体进行更有信息的检测。

为了讨论进一步检测选项的可用性，为一般检测选择提供帮助，或为这些结果的解释提供帮助，可以联系梅奥诊所实验室的遗传顾问，电话800-533-1710。

技术的局限性:

下一代测序可能无法检测到所有类型的基因组变异。在极少数情况下，可能会出现假阴性或假阳性结果。对于某些靶区，覆盖深度可能是可变的，但检测性能低于最低可接受标准或失败区域将被注意到。鉴于这些局限性，阴性结果并不排除遗传疾病的诊断。如果怀疑有特定的临床疾病，可以考虑采用其他方法进行评估。

如果患者曾接受过异基因造血干细胞移植或最近的异体输血，这些结果可能由于捐献者DNA的存在而不准确。请致电梅奥yabo208诊所实验室，了解如何对接受骨髓移植的病人进行检测。

由于检测技术的限制，可能存在基因区域无法有效扩增用于测序或缺失和重复分析，包括同源区域、高鸟嘌呤-胞嘧啶(GC)含量和重复序列。根据内部实验室标准，采用替代方法对选定的可报告变型进行确认。

该方法不能可靠地检测40个或更多碱基对(bp)的插入/缺失(indels)，包括Alu插入、长核杂散元素(LINES)和短核杂散元素(SINES)。生物信息学软件管道被证实可以检测95%的75 bp以下的缺失和47 bp以下的插入。

此外，低水平的镶嵌变体可能无法检测到。

这个测试不是为了区分体细胞变异和种系变异。如果有可能任何检测到的变异是体细胞，可能需要额外的检测来澄清结果的重要性。

Variants-Policy重新分类:

目前，实验室定期系统地审查以前分类过的变种还不是标准做法。实验室鼓励医疗保健提供者随时与实验室联系，以了解特定变体的状态随时间的变化情况。

变体的评估:

根据美国医学遗传学和基因组学学院(ACMG)和分子病理学协会(AMP)的建议，评估和分类变异。(1)其他基因特异性指南也可以考虑。变异是根据已知的、预测的或可能的致病性进行分类的，并以解释性注释详细说明其潜在的或已知的意义。分类为良性或可能良性的变异没有报告。

多种硅评价工具可用于帮助解释这些结果。硅评估工具预测的准确性高度依赖于给定基因的可用数据，定期更新这些工具可能会导致预测随着时间的推移而改变。从硅评估工具的结果应解释谨慎和专业的临床判断。未预测会影响剪接或导致疾病的内含子和同义序列变异尚未报道。

1.Richards S, Aziz N, Bale S，等:解释序列变异的标准和指南:美国医学遗传学和基因组学学院和分子病理学协会的联合共识建议。Genet Med. 2015 May;17(5):405-424

2.Wortmann SB, Kluijtmans LA, Engelke UF, Wevers RA, Morava e。[J] .遗传杂志，2012;35(1):13-22。doi: 10.1007 / s10545 - 010 - 9210 - 7

3.Manoli I, Venditti CP:支链氨基酸代谢紊乱。中国罕见病杂志2016;1(2):91-110。doi: 10.3233 / trd - 160009 4。Wortmann SB, Duran M, Anikster Y，等:以3-甲基谷酰胺酸尿为鉴别特征的先天性代谢错误:正确的分类和命名。J . Inherit Metab Dis. 2013;36:923-928。doi: 10.1007 / s10545 - 012 - 9580 - 0

• 分子遗传学:生化疾病患者信息
• 基因检测的知情同意
• 基因检测的知情同意(西班牙语)
• 3-甲基谷酰胺酸尿检测的靶向基因和方法详细信息