测试ID：艾滋病毒
HIV-1基因型整合酶抑制剂耐药，血浆

HIV-1整合酶区域HIV-1基因型突变的鉴定以预测接受整合酶链转移抑制剂(即双替格拉韦、多卢格拉韦、艾尔特格拉韦)的HIV-1感染患者的抗逆转录病毒耐药性

指导开始或改变治疗HIV-1感染的药物组合

看到HIV治疗监控算法在特殊说明中。

在接受高效抗逆转录病毒疗法(HAART)的hiv -1感染患者中，抗病毒药物耐药性可能危及高活性抗逆转录病毒疗法(HAART)。当联合治疗失败时，检测和分析HIV基因型突变可以指导抗逆转录病毒治疗的必要改变，降低HIV-1病毒载量，从而改善患者预后。

HIV-1是一种感染细胞的RNA病毒，在病毒逆转录酶(RT)的作用下转化为互补DNA (cDNA)。RT几乎没有校对能力，因此在原病毒DNA中包含错误。当原病毒DNA被转录为RNA时，这些错误被转录为传染性病毒颗粒。类似地，蛋白酶(PR)催化多聚蛋白产生活性病毒复制所必需的多肽。尽管HAART(核苷类似物、非核苷药物、蛋白酶抑制剂和/或整合酶链转移抑制剂的组合)可能在降低病毒载量方面有效，由于来自抗病毒治疗的选择性压力，在药物靶向HIV基因座中产生的基因型突变可能导致抗病毒耐药性，从而可能危及这种治疗。

药物靶向HIV-1序列的扩增和分析允许鉴定可能导致抗病毒耐药性的核苷酸序列和相关氨基酸密码子的变化。通过将患者HIV-1菌株的序列数据与野生型HIV-1菌株的菌株进行比较来鉴定这种基因型改变。这些基因型突变与抗病毒抗性有关的重要性，由Stanford HiVDB程序基因型阻力解释算法（http://sierra2.stanford.edu/sierra/servlet/jsierra）产生和使用的一组解释规则最终的解释。

在斯坦福大学的HIVdb项目中，基因型突变是根据使用ViroLogic PhenoSense分析(Monogram Biosciences Inc, San Francisco, US)或HeLa-CD4报告基因分析进行的表型抗病毒敏感性测试进行分类和解释的。每个突变都被赋予一个药物惩罚分数，与特定抗病毒药物相关的所有突变产生的总分数被用来估计对该药物的耐药性水平。这些解释规则可能会由斯坦福大学HIVdb团队在回顾最新发表的HIV-1基因型耐药突变数据后定期更新。

不适用

可检测到的对抗病毒药物产生耐药性的HIV-1基因型突变被报道为氨基酸密码子改变(如N155H)，以及当前fda批准的整合酶链转移抑制剂(bictegravir, dolutegravir, elvitegravir和raltegravir)的相关耐药性解释。

敏感(SUSC)表明患者HIV-1菌株中存在的基因型突变尚未与特定药物的抗性有关（斯坦福HIVDB总得分0至9）。

潜在低水平抗性(PLR)表明检测到的基因型突变可能与降低对特定药物的敏感性有关(Stanford HIVdb评分10至14)。

低电阻(LR)表明检测到的基因型突变与降低对特定药物的敏感性有关(Stanford HIVdb评分15 - 29)。

接触电阻(IR)表明检测到的基因型突变与降低对特定药物的敏感性有关(Stanford HIVdb评分30 - 59)。

高级阻力(人力资源)表明检测到的基因型突变与对特定药物敏感性的最大程度降低有关(Stanford HIVdb评分>或=60)。

无法基因型表明病毒靶序列质量较差，无法可靠地确定抗病毒药物耐药性。这一结果可能是由于病毒载量低，病毒靶序列不明确或不完整，PCR抑制剂的存在，以及/或PCR或测序引物结合区域的突变。

不确定的表明由于PCR抑制剂的存在，PCR或测序引物结合区域的突变，或不明确或不完整的病毒靶序列，不允许可靠地分析确定抗病毒耐药，该分析无法可靠地确定抗病毒耐药。

由于产生结果的复杂性，国际抗病毒学会-美国专家小组建议对基因分型和表型检测结果进行专家解释，以便对患者进行护理管理。患者对抗病毒治疗的反应取决于多个因素，包括患者的病毒耐药比例、患者对处方药物治疗的依从性、患者获得充分护理的机会、药物的药代动力学和药物相互作用。在做出治疗决定时，耐药试验结果应仅与临床表现和其他实验室标记物结合来解释。

对药物缺乏耐药性并不排除感染患者体内存在耐药病毒宿主。

HIV-1基因型测试不是直接测量耐药性的方法。虽然基因型检测可以检测到相关HIV-1基因组的突变，但这些突变的重要性需要仔细解释，以预测药物敏感性。当血浆HIV-1病毒载量低于500拷贝/mL时，这种检测方法扩增靶点和检测基因型突变的能力很差，而且不可靠。提交本试验的标本应至少包含500拷贝/mL的HIV-1 RNA。

该分析方法已被优化用于HIV-1 M组B亚型的基因型分析，其中包括美国和欧洲感染患者的大多数HIV-1毒株。HIV-1的N和O组，以及一些M组，非b亚型可能无法使用该检测方法检测到，这些HIV-1的其他组和亚型的突变和耐药突变的意义尚不清楚。

斯坦福HIVdb程序基因型抗性解释算法用于最终解释的基因型突变数据库和解释规则会定期更新。因此，检测结果不一定包括当前医学文献中描述的所有与药物相关的突变。

除耐药外，治疗失败的可能原因包括服药依从性差、药物效价和药代动力学的个体差异(如核苷磷酸化不足)。

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