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确定林奇综合症的诊断
识别家族msh2, msh6, pms2,或者EPCAM变异允许在家庭成员中进行预测性测试
该测试包括下一代测序,Sanger测序,阵列比较基因组杂交,和多重连接依赖的探针扩增,以评估变异和大缺失/重复一种,MSH2,MSH6,PMS2,EPCAM基因。桑格测序也可用于确认检测到的变异。
事先授权可用于本分析;看到的特别指示。
看到林奇综合症测试算法在特殊的说明中。
虽然一般人群的结肠直肠癌的风险为6%,但很少结肠癌可归因于与单一异常基因相关的遗传因素,这些因素涉及倾向于在家庭中增加癌症风险的血迹。
林奇综合征(也称为遗传性非息肉病结直肠癌或HNPCC)是一种常染色体显性遗传性癌症综合征,与错配修复基因的种系变异有关,一种,MSH2,MSH6,PMS2.删除在3'结束EPCAM基因,导致失活MSH2也与林奇综合症有关。
林奇综合征的主要特征是结肠直肠癌和子宫内膜癌的风险显著增加。结直肠癌的终生风险是高度可变的,并依赖于相关的基因。结肠直肠癌的风险相关一种和MSH2变异(约50%-80%)的风险通常高于其他林奇综合征相关基因的变异相关的风险。子宫内膜癌的终生风险(约25%-60%)也是高度可变的。肿瘤范围内的其他恶性肿瘤包括胃癌、卵巢癌、肝胆道和泌尿道癌以及小肠癌。这些癌症的终生风险低于15%。在4个错配修复基因中PMS2基因决定了林奇症候群中所有肿瘤的最低风险。
国家综合癌症网络和美国癌症协会提供关于林奇综合症患者的医疗管理建议。
将提供一份解释性报告。
根据美国医学遗传学和基因组学学院的建议,对所有检测到的变异进行评估。(1)根据已知、预测或可能的致病性对变异进行分类,并报告解释性评论,详细说明它们的潜在或已知意义。
临床相关性:
一些对乳腺癌有遗传易感性的个体可能有一种该方法无法识别的变异(例如,启动子改变,深度内含子改变)。因此,变异的缺失并不排除个体或家庭中遗传易感性患乳腺癌的可能性。对于预测测试,首先证明受影响家庭成员中存在基因变异是很重要的。
检测结果应结合临床表现、家族史和其他实验室数据进行解释。如果给出的信息不准确或不完整,我们对结果的解释可能会出现错误。强烈建议接受预测性检测的患者在检测前和检测结果出来后接受基因咨询。
技术的局限性:
在一些情况下,可以鉴定未确定意义的DNA变体。由于下一代测序的局限性,可以检测到高于93%的插入和缺失,分别可以分别检测到20个碱基和43个碱基。如果仍怀疑诊断,请考虑使用传统的Sanger方法进行全基因测序。将通过阵列对比基因组杂交(ACGH)或多重连接依赖性探针扩增(MLPA)来检测单个或多外显子缺失以及全基因缺失。存在罕见的改变,可能导致假阴性或假阳性结果。
如果获得的结果与临床结果不一致,则应考虑进行额外的检测。
评估工具:
多种硅质评价工具被用于帮助解释这些结果。这些工具定期更新;因此,对这些算法的更改可能导致对给定更改的不同预测。此外,这些工具在确定致病性方面的可预测性目前还没有得到验证。
除非报道或预测会引起疾病,否则未报道内含子深部的改变或不会导致氨基酸取代的改变。这些和为该患者确定的常见改变可根据要求提供。
Variants-Policy重新分类:
目前,实验室系统地重新审查检测和报告的可能有害的改变或意义不确定的变体还不是标准做法。实验室鼓励卫生保健提供者随时与实验室联系,以了解某一特定变体的状态随时间的变化情况。
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