测试ID: MITOT
组合的线粒体分析，线粒体全基因组和核基因面板各不相同

核编码基因或线粒体基因组中变异导致线粒体疾病的诊断

对先前针对特定线粒体疾病相关基因的靶向基因变异分析为阴性的患者进行的二级检测

鉴定已知与线粒体疾病相关的变体，允许预测风险的家庭成员

这个测试包括下一代测序(上天)和桑格测序来评估核基因变异的上市整个线粒体基因组的面板和放大远程聚合酶链反应(LR-PCR)其次是测序捷平台评估线粒体基因组内的变异。

该测试包括下一代测序(NGS)和补充Sanger测序，以评估以下基因的变异:AASS, ABAT, ABCB7, ACACA, ACAD9, ACO2, AFG3L2, AGK, AIFM1, ALDH3A2, AMPD1, APOPT1, APTX, ATP5A1, ATP5E, ATP5G3, ATPAF2, AUH, BCS1L, BOLA3, C12orf65, CA5A, CHAT, CLPP, COA5, COA6, COQ2, COQ4, COQ6, COQ8A (ADCK3)， COQ4, COQ9, COX10, COX14, COX15, COX20, COX4I2, COX6B1, COX7B, CYC1, D2HGDH, DARS2, DGUOK, DLAT, DLD, DNA2, DNAJC19，Dnm1l, ears2, elac2, etfa, etfb, etfdh, ethe1, fars2, fastkd2, fbxl4, fh, foxred1, fxn, gamt, gars, gcdh, gfer, gfm1, hars2, hibch, iars2, iba57, idh2, iscu, l2hgdh, lars2, lias, lrpprc, lyrm4, lyrm7, mars2, mgme1, micu1, mpc1, mpv17, mrpl3, mrpl44, mrps16, mrps22, mtfmt, mto1, mtpap, ndufa1, ndufa2, ndufa9, ndufa10, ndufa11, ndufa12, ndufa1，Ndufaf2、ndufaf3、ndufaf4、ndufaf5、ndufaf6、ndufb9、ndufs1、ndufs2、ndufs3、ndufs4、ndufs7、ndufs8、ndufv1、ndufv2、nfu1、nubpl、ogdh、opa1、opa3、oxct1、pank2、pc、pck2、pdha1、pdhb、pdhx、pdp1、pdss1、pdss2、pnkd、pnpt1、polg、polg2、pus1、rars2、rmnd1、rrm2b、sacs、sars2、sco1、sco2、sdhaf1、serac1、sfxn4、slc19a3、slc25a1、SLC25A3、SLC25A4、SLC25A12、SLC25A19、SLC52A2、sucl2、SUCLG1、SUGCT、SURF1、TACO1、TARS2、TAZ、TIMM8A、TIMM44、TK2、TMEM126A、TMEM70、TPK1、TRAP1、TRMU、TSFM、TTC19、TUFM、TWNK (C10orf2)、TYMP、UQCRB、UQCRC2、UQCRQ、VARS2、XPNPEP3、和YARS2。

看由线粒体核基因面板询问的靶向基因详细信息请参阅本试验所鉴定的靶向基因区域。

如果接受了皮肤活检，则需要进行成纤维细胞培养和生化研究的低温保存，并另行收费。

以下算法可在特殊说明:

-癫痫：无法解释的难治性和/或家族性测试算法

-神经肌肉肌病检测算法

线粒体在真核生物中占有独特的地位。它是能量代谢的场所，它是唯一的亚细胞细胞器，由来自两个基因组的蛋白质组成，线粒体和核。由于线粒体基因组或线粒体核基因变异的一组遗传疾病已经被很好地描述。

线粒体疾病的诊断尤其具有挑战性，因为其表现可能发生在任何年龄，几乎涉及任何器官系统，并与各种严重程度相关。由于各种线粒体疾病的临床表型有相当多的重叠，如果不进行基因检测，往往很难区分这些特定的遗传疾病。这项测试利用大规模的平行测序，也称为下一代测序(NGS)，分析176个与线粒体疾病有关的核编码基因，并确定整个16569个碱基对线粒体基因组的确切序列。

这项检测的用途是帮助诊断由核编码基因和线粒体基因组变异引起的线粒体疾病。涉及核基因的疾病包括线粒体蛋白质合成障碍、辅酶Q10生物合成障碍、呼吸链复合物和线粒体DNA维持障碍(即线粒体DNA耗尽障碍)。线粒体基因组疾病包括由点改变引起的疾病，如线粒体脑肌病、乳酸酸中毒、卒中样发作(MELAS)、红纤维参差不齐的肌阵挛性癫痫(merf)、线粒体肌病(MM)、神经源性肌无力、共济失调和视网膜色素变性(NARP)、利综合征、Leber遗传性视神经病变(LHON)和慢性进行性眼外麻痹(CPEO)。除了检测到这些疾病的单个碱基变化外，还检测到与卡恩斯-塞尔综合征或皮尔森综合征相关的大缺失。与核基因的变异不同，核基因的变异存在于0、1或2个拷贝中，线粒体变异可以存在于整个细胞器的任何部分，这一现象被称为异质性。通常情况下，疾病表现的严重程度与异质性的程度有关。线粒体变异比例高的个体比等位基因变异比例低的个体存在更严重的疾病。NGS检测野生型(或正常)线粒体序列背景中变异等位基因的灵敏度约为10%。

看由线粒体核基因面板询问的靶向基因请参阅本试验所鉴定的靶向核基因的详细信息。

将提供解释性报告。

所有检测到的改变都是根据美国医学遗传学和基因组学的建议进行评估。（1）变体基于已知，预测或可能的致病性分类，并报告了细节其潜在或已知意义的解释性评论。对于线粒体DNA（MTDNA）改变，还将报告将每个单一核苷酸或吲哚（插入/缺失）变体的异质度，定义为变体序列的比例（百分比）读取到读取的总数。将报告大型MTDNA缺失作为同源性或异质的，但由于可能的优先扩增较小的缺失产物通过远程PCR，因此不会估计异质程度。

临床相关性:

在面板或线粒体基因组上涉及更多基因涉及的小百分比可以具有未被进行的方法鉴定的变体。因此，不存在变体，不会消除线粒体疾病的可能性。对于对无症状的预测性进行预测性测试，重要的是首先记录受影响的家庭成员中存在基因变体的存在。

检测结果应结合临床表现、家族史和其他实验室数据进行解释。如果提供的信息不准确或不完整，可能会导致对结果的误解。

技术限制：

在某些情况下，可以鉴定出意义不明的DNA变异。

线粒体DNA水平的耗竭不是在该测定的范围内。

存在罕见的改变，可能导致假阴性或假阳性结果。如果获得的结果与临床结果不符合，则应考虑额外的测试。

评估工具：

使用多种硅基评估工具来帮助解释这些结果。这些工具定期更新;因此，对这些算法的改变可能导致给定的更改的不同预测。另外，目前未经验证这些用于测定致病性的工具的可预测性。

除非有报告或预测会引起疾病，否则不会导致氨基酸替代的蛋白质编码基因的改变没有报道。将报告患者的线粒体DNA单倍群分类，但定义单倍群的单个核苷酸变化将不报告。这些和为该患者确定的常见改变可根据要求提供。

重新分类变体 - 政策：

此时，实验室没有标准做法，以系统地评估可能先前检测到和报告的不确定意义的有害改变或变体。该实验室鼓励医疗保健提供者随时联系实验室，以了解特定变体的解释和分类可能随着时间的推移而变化。

1.Richards S, Aziz N, Bale S，等:解释序列变异的标准和指南:美国医学遗传学和基因组学学院和分子病理学协会的联合共识建议。Genet Med. 2015 May;17(5):405-424

2.Munnich A, Rotig A, Cormier-Daire V, Rustin P:呼吸链缺失的临床表现。在:Valle D, Antonarakis S, Ballabio A, Beaudet AL, Mitchell GA编辑。遗传疾病的在线代谢和分子基础。麦格劳-希尔;2019.2020年9月28日生效。https://ommbid.mhmedical.com/content.aspx?bookid=2709§ionid=225086827

3.Wallace DC, Lott MT, Brown MD, Kerstann K:线粒体和神经眼科疾病。见:Valle D, Antonarakis S, Ballabio A, Beaudet AL, Mitchell GA等人编。遗传疾病的在线代谢和分子基础。麦格劳-希尔;2019.2020年9月28日生效。https://ommbid.mhmedical.com/content.aspx?bookid=2709§ionid=225088522

4.黄丽娟:线粒体疾病的分子遗传学。Dev Disabil Res. Rev 2010六月;16(2):154-162

• 肌肉活组织检查标本制备
• 分子遗传学：生物化学障碍患者信息
• 知情同意遗传测试
• 由线粒体核基因面板询问的靶向基因
• 癫痫：无法解释的难治性和/或家族性测试算法
• 神经肌肉肌病检测算法
• 基因检测的知情同意(西班牙语)