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该检测采用了一种改进的方法,包括使用fda批准的ViroSeq HIV-1基因分型系统v2.0。在给定的人类血浆标本中,用手工方法提取和纯化HIV-1 RNA。用ab3500xl基因分析仪扩增了HIV-1密码子1 ~ 99的全部蛋白酶基因和血浆中HIV-1密码子1 ~ 335的三分之二逆转录酶(RT)基因,并进行了7次正向和反向测序反应。根据制造商的说明书,使用ViroSeq HIV-1基因分型系统软件v3对患者产生的HIV-1病毒序列数据进行组装、编辑和分析。将收集的一致序列与已知的参考(野生型)HIV-1毒株序列进行比较,使用Stanford HIVdb程序基因型耐药解释算法(http://sierra2.stanford.edu/sierra/servlet/JSierra)确定所有与耐药相关的突变密码子的存在。将观察到的突变密码子与已知的HIV-1基因型耐药突变列表进行比较,并解释对相应抗逆转录病毒药物的敏感性。(包装插入:ViroSeq HIV-1基因分型系统v2.0;Abbott Molecular, Inc., Des Plaines, IL. 04/2016;未发表的梅奥法)
不同