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活菌和非活菌的临床分离菌被转移到一个1 mcL的充满分离菌的回路中,进入棉签中和缓冲液(NB)管进行热/物理裂解,然后在测试前以1:100稀释。PCR检测采用靶特异性检测系统,包括引物、TaqMan检测探针和SimpleProbe,用于基于熔体曲线分析的基因分型,靶向23S核糖体RNA基因。LightCycler 480 II仪器在PCR循环过程中通过荧光对目标核酸序列进行扩增和监测。扩增产物的检测是基于TaqMan探针原理。对于PCR产物检测,TaqMan探针与扩增靶的互补链结合。具有5 ' -3 '核酸外切酶活性的特异性PCR Taq聚合酶降解探针,释放荧光团并打破其与猝灭分子的接近,允许荧光团的荧光。PCR循环结束时,扩增产物热变性,然后冷却,允许荧光素标记的SimpleProbe退火到扩增靶区的18碱基对区域,其中包括与克拉霉素耐药相关的2个位置突变。温度缓慢升高,同时持续监测荧光。整个过程在一个封闭的系统中完成,以减少污染。此外,污染控制是通过UNG酶处理和包含dUTPs的主混合来实现的。Chen D, Cunningham SA, Cole N, et al .:表型和分子抗菌素敏感性幽门螺杆菌在美国。Antimicrob Agents Chemother 2016;61:e02530-16)
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