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下一代测序(NGS)用于测试线粒体基因组内的变体(包括13个蛋白质编码基因,22转移RNA基因和2个核糖体RNA基因)并确定患者的线粒体HAPLOG组。首先通过凝胶电泳(作为尺寸移位的聚合酶链反应带)检测线粒体基因组内的大缺失,然后从NGS数据确定MTDNA中缺失的位置。
通过软件包HaploGrep计算Haplogroup。(Kloss-Brandstatter A,Pacher D,Schonherr S,等:HAPLOGrep:一种快速可靠的线粒体DNA Haplogroups自动分类算法。哼哼2011年1月; 32:25-32)和Phylotree。(van Oven M,Kayser M:更新了全球人体线粒体DNA变异的综合系统发育树。嗡嗡声。2009; 30 [2]:e386-e394在www.phylotree.org提供)
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