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慢性胰腺炎患者疑似家族性或遗传性胰腺炎临床诊断的确认
个体或家庭中导致胰腺炎的基因突变的鉴定
基因突变的鉴定,以便在家庭成员中进行预测和诊断测试
该测试包括桑格测序,以评估突变PRSS1基因,下一代测序来评估基因突变雌性生殖道,CTRC,SPINK1基因,和多重连接依赖的探针扩增,用于检测内部的大缺失和重复雌性生殖道基因。
遗传性胰腺炎(HP)是指一个家族中有2个或2个以上的个体感染至少2代胰腺炎。几个基因的突变,包括雌性生殖道,PRSS1 CTRC,和SPINK1有慢性胰腺炎的遗传易感性。疾病易感性可能是单基因的,就像PRSS1,基因的或多基因的,多因子的,其中多基因和环境因素在疾病表达中发挥作用。
PRSS1:
HP最常见的单基因原因是阳离子胰蛋白酶原(PRSS1)基因。突变PRSS1基因以常染色体显性遗传。据报道,多达80%的症状遗传性胰腺炎患者有病因PRSS1突变。HP在临床上不能与其他形式的胰腺炎区分开来。然而,PRSS1突变通常局限于有胰腺炎家族史的个体,很少在酒精诱发或热带胰腺炎患者中发现。虽然已经发现了几种突变,但R122H、N29I和A16V突变是最常见的致病突变PRSS1与惠普有关。数据表明,R122H突变比A16V突变导致更严重的疾病和更早出现症状。HP患者患胰腺癌的风险也会增加。研究估计一生中患胰腺癌的风险高达40%。
SPINK1:
双等位基因突变SPINK1基因与慢性胰腺炎的易感性增加有关,尤其是在没有PRSS1突变;然而,双等位基因突变是否足以引起慢性胰腺炎尚不清楚。此外,杂合的SPINK1当观察到其他基因的突变时,突变似乎可以改变疾病的严重程度。不像PRSS1突变,SPINK1突变与酒精诱发的热带胰腺炎有关。
雌性生殖道:
胰腺炎是一种已知的非典型表现雌性生殖道。中有2个突变的相关疾病雌性生殖道基因识别。然而,雌性生殖道突变也可以与CTRC, SPINK1,体内或CASR研究胰腺炎的易感性。当在一个SPINK1突变,例如杂合突变雌性生殖道与普通人群相比,胰腺炎的风险增加了2- 5倍。
CTRC:
突变CTRC在慢性胰腺炎患者中观察到与其他危险因素相关的突变,如雌性生殖道或SPINK1或特定的环境风险因素。因此,慢性胰腺炎可能是由于CTRC突变在其他危险因素的背景下而不是CTRC突变。
将提供一份解释性报告。
所有检测到的变异将根据美国医学遗传学和基因组学学院(AMCG)的建议进行评估。(1)变异将根据已知、预测或可能的致病性进行分类,并报告解释性评论,详细说明它们的潜在或已知意义。
一些被诊断为遗传性胰腺炎和/或被检测基因参与的个体可能有一个突变,而该方法无法识别(例如,基因组大缺失或重复,启动子突变,深度内含子突变)。因此,没有突变并不排除遗传性胰腺炎或胰腺炎易感性诊断的可能性。对于无症状个体的预测检测,首先证明受影响家庭成员中存在基因突变是很重要的。
检测结果应结合临床表现、家族史和其他实验室数据进行解释。如果给出的信息不准确或不完整,我们对结果的解释可能会出现错误。
技术的局限性:
在某些情况下,可以鉴定出意义不明的DNA变异。
存在可能导致假阴性或假阳性结果的罕见多态性。如果获得的结果与临床结果不一致,则应考虑进行额外的检测。
除了与疾病相关的探针,多重连接依赖的探针扩增(MLPA)技术利用定位于染色体其他区域的探针作为内部控制。在某些情况下,这些控制探头可能会检测到本试验没有专门针对的其他疾病或条件。通常不报告控制探针的结果。然而,在临床相关信息被确定的情况下,将通知订购医生结果,并提供任何适当的后续检测建议。
评估工具:
多种硅质评价工具被用于帮助解释这些结果。这些工具定期更新;因此,对这些算法的更改可能导致对给定更改的不同预测。此外,这些工具用于确定致病性的可预测性目前尚未得到验证。
除非有报告或预测会引起疾病,否则不会导致氨基酸替代的蛋白质编码基因的改变没有报道。这些和为该患者识别的常见多态性可根据要求提供。
Variants-Policy重新分类:
根据美国医学遗传学和基因组学学院(ACMG)的建议,对所有检测到的变化进行评估。变异是根据已知的、预测的或可能的致病性进行分类的,并以解释性注释详细说明其潜在的或已知的意义。目前,实验室系统地审查以前已发现和报告的可能的致病改变或意义不确定的变异还不是标准做法。实验室鼓励卫生保健提供者随时与实验室联系,以了解某一特定变体的状态随时间的变化情况。
1.Richards S, Aziz N, Bale S,等:解释序列变异的标准和指南:美国医学遗传学和基因组学学院和分子病理学协会的联合共识建议。Genet Med 2015 May;17(5):405-424
2.遗传性胰腺炎:当前的观点。临床试验胃肠病。2016年7月26日;9:197-207
3.胰腺炎的遗传学:临床医生和遗传顾问的更新。目前胃肠病学报告2012;14(2):112-117
4.Ellis I:遗传性胰腺炎的遗传咨询——阳离子胰蛋白酶原基因、囊性纤维化和丝氨酸蛋白酶抑制剂Kazal type 1的分子遗传学检测的作用。胃肠病临床杂志2004;33:839-854
5.胰腺炎的概述。In GeneReviews-NCBI Bookshelf. 2014年3月13日。编辑:RA Pagon,议员Adam, HH Ardinger等:华盛顿大学。西雅图佤邦。1993 - 2018。2019年1月访问。网址:http://www.ncbi.nlm.nih.gov/books/NBK190101/