测试ID: UCDP
尿素循环障碍基因图谱，各不相同

随访提示尿素循环紊乱(UCD)的异常生化结果

建立对UCD患者的分子诊断

识别已知与UCD相关的基因变异，以便对有风险的家庭成员进行预测性检测

该测试利用下一代测序来检测与尿素循环紊乱(UCD)相关的16个基因的单核苷酸和拷贝数变异。该测试包括下一代测序，以检测所示基因的变异:Aldh18a1, arg1, arg2, asl, ass1, ca5a, cps1, glud1, glul, nags, oat, otc, slc25a13, slc25a15, slc7a7, umps．有关更多细节，请参见方法描述。

致病变异的鉴定可能有助于UCD的诊断、预后、临床管理、家族筛查和遗传咨询。

可能会考虑/建议进行额外的一级测试。

有关更多信息，请参见咨询信息。

尿素循环障碍(UCD)是一组遗传的氮解毒障碍，当尿素循环中的任何一种酶活性减少或缺乏时导致。这些疾病包括氨甲酰磷酸合成酶I (CPS I)缺乏，鸟氨酸转氨基甲酰基酶(OTC)缺乏，精氨酸琥珀酸合成酶缺乏(瓜氨酸血症)，精氨酸琥珀酸裂解酶缺乏(精氨酸琥珀酸尿)，精氨酸酶缺乏，辅助因子生产者，n -乙酰谷氨酸合成酶(NAGS)缺乏，两种氨基酸转运体，鸟氨酸转位酶缺乏症(高鸟氨酸血症、高氨血症、同瓜氨酸尿综合征:HHH综合征)和柑橘素缺乏症。尿素循环的作用是代谢和清除废氮，该途径的任何步骤的缺陷都可能导致神经系统中有毒氨的积累。尿素循环还负责内源性的瓜氨酸、鸟氨酸和精氨酸的产生。

完全缺乏尿素循环酶的婴儿通常在出生时表现正常，但由于氨水平升高，他们在新生儿期表现为嗜睡、癫痫、高通气或低通气，最终昏迷或死亡。部分酶缺乏的个体可能出现在生活的后期，典型的急性疾病或其他分解代谢应激。症状可能不那么严重，可能表现为精神病发作、嗜睡、周期性呕吐和行为异常。由于鸟氨酸氨基转移酶(OAT)缺乏而导致鸟氨酸代谢受损的患者，可能在生命的第4至60年出现儿童期开始的近视进展到视力丧失。患者可能伴有或不伴有高氨血症，但血浆鸟氨酸显著升高。

所有的UCD都是常染色体隐性遗传疾病，除了OTC缺乏，它是x连锁的。UCD可能与氨气升高、负离子间隙正常和葡萄糖正常有关。

鉴于UCD的广泛临床谱和遗传异质性，这种全面的基因图谱有助于建立对具有提示临床和生化特征的患者的诊断。分子基因检测可以帮助区分疾病，并进行诊断确认。

建议将血浆定量氨基酸(AAQP / amino acids, quantitative, plasma)和尿OROT / orotic acid, Random, Urine)等生化检测结合作为评估患者UCD的一级检测。

UCD的急性治疗包括透析和使用氮清除药物以降低氨浓度。慢性治疗通常包括限制膳食蛋白质和补充必需氨基酸。最近，肝移植已经成功地用于治疗一些病人。

将提供一份解释性报告。

根据美国医学遗传学和基因组学学院(ACMG)的建议，对所有检测到的变异进行评估。(1)根据已知、预测或可能的致病性对变异进行分类，并报告解释性评论，详细说明它们的潜在或已知意义。

临床相关性:

检测结果应结合临床表现、家族史和其他实验室数据进行解释。如果提供的信息不准确或不完整，可能会导致对结果的误解。

如果检查是由于有临床意义的家族史而进行的，那么首先检查受影响的家庭成员往往是有用的。在受影响的家庭成员中发现可报告的变异将有助于对危险个体进行更有信息的检测。

为了讨论进一步检测选项的可用性，为一般检测选择提供帮助，或为这些结果的解释提供帮助，可以联系梅奥诊所实验室的遗传顾问，电话800-533-1710。

技术的局限性:

下一代测序可能无法检测到所有类型的基因组变异。在极少数情况下，可能会出现假阴性或假阳性结果。对于某些靶区，覆盖深度可能是可变的，但检测性能低于最低可接受标准或失败区域将被注意到。鉴于这些局限性，阴性结果并不排除遗传疾病的诊断。如果怀疑有特定的临床疾病，可以考虑采用其他方法进行评估。

如果患者曾接受过异基因造血干细胞移植或最近的异体输血，这些结果可能由于捐献者DNA的存在而不准确。请致电梅奥yabo208诊所实验室，了解如何对接受骨髓移植的病人进行检测。

由于检测技术的限制，可能存在基因区域无法有效扩增用于测序或缺失和重复分析，包括同源区域、高鸟嘌呤-胞嘧啶(GC)含量和重复序列。根据内部实验室标准，采用替代方法对选定的可报告变型进行确认。

该方法不能可靠地检测40个或更多碱基对(bp)的插入/缺失(indels)，包括Alu插入、长核杂散元素(LINES)和短核杂散元素(SINES)。生物信息学软件管道被证实可以检测95%的75 bp以下的缺失和47 bp以下的插入

此外，低水平的镶嵌变体可能无法检测到。

这个测试不是为了区分体细胞变异和种系变异。如果有可能任何检测到的变异是体细胞，可能需要额外的检测来澄清结果的重要性。

Variants-Policy重新分类:

目前，实验室定期系统地审查以前分类过的变种还不是标准做法。实验室鼓励卫生保健提供者随时与实验室联系，以了解某一特定变体的状态随时间的变化情况。

变体的评估:

根据美国医学遗传学和基因组学学院(ACMG)和分子病理学协会(AMP)的建议，评估和分类变异。(1)其他基因特异性指南也可以考虑。变异是根据已知的、预测的或可能的致病性进行分类的，并以解释性注释详细说明其潜在的或已知的意义。分类为良性或可能良性的变异没有报告。多种硅评价工具可用于帮助解释这些结果。硅评估工具预测的准确性高度依赖于给定基因的可用数据，定期更新这些工具可能会导致预测随着时间的推移而改变。从硅评估工具的结果应解释谨慎和专业的临床判断。未预测会影响剪接或导致疾病的内含子和同义序列变异尚未报道。

1.Richards S, Aziz N, Bale S，等:解释序列变异的标准和指南:美国医学遗传学和基因组学学院和分子病理学协会的联合共识建议。Genet Med. 2015 May;17(5):405-424

2.尿素循环酶。在:Valle D, Antonarakis S, Ballabio A, Beaudet A, Mitchell GA。eds。遗传疾病的在线代谢和分子基础。麦格劳-希尔教育;2019.2020年10月29日生效。可以在https://ommbid.mhmedical.com/content.aspx?sectionid=225084071&bookid=2709&Resultclick=2

3.Haberle J, Burlina A, Chakrapani A，等:尿素循环障碍的诊断和管理建议指南:第一次修订。J Inherit Metab Dis. 2019;1-39。doi: 10.1002 / jimd.12100

4.Valle D, Simell O:高鸟氨酸血症。在:Valle D, Antonarakis S, Ballabio A, Beaudet A, Mitchell GA。eds。遗传疾病在线代谢和分子基础的研究——graw - hill教育2019.2020年10月29日生效。可以在https://ommbid.mhmedical.com/content.aspx?sectionid=225083672&bookid=2709&Resultclick=2

5.Foshci FG, Morelli MC, Savini S，等:尿素循环障碍:一例成功肝移植病例报告并文献综述。世界胃肠病学杂志。2015年4月7日;21(13):4063-4068

6.尿素循环障碍综述。见:Adam MP, Ardinger HH, Pagon RA等编。GeneReviews[网络]。华盛顿大学西雅图分校;2003.2017年6月22日更新。2020年1月3日。可以在www.ncbi.nlm.nih.gov /书/ NBK1217 /

• 分子遗传学:生化疾病患者信息
• 基因检测的知情同意
• 基因检测的知情同意(西班牙语)