测试ID: MMAGP
甲基丙二酸尿基因图谱，各不相同

追踪异常生化结果提示甲基丙二酸血症

建立甲基丙二酸血症患者的分子诊断方法

鉴定已知与甲基醛酸血症相关的基因内的变体，允许对风险的家庭成员预测测试

该测试利用下一代测序来检测与甲基丙二酸尿相关的25个基因的单核苷酸和拷贝数变异:ABCD4那ACSF3那Aldh6a1.那飞行员那CD320那古姆恩那CBLIF.那HCFC1.那LMBRD1那MCEE.那MMAA.那MMAB.那mmachc.那mmadhc.那MTHFR.那地铁那MTRR.那mmut.那PRDX1那Sycla2.那SUCLG1.那TCN1那TCN2.那THAP11那ZNF143。看甲基醛酸尿尿基因组的靶向基因和方法细节在特殊的说明和方法描述中获取其他详细信息。

鉴定致病变异可有助于诊断，预后，临床管理，家族性筛查和甲基丙氨酸癌的遗传咨询。

可能会考虑/建议进行额外的一级测试。

有关更多信息，请参阅订购指导。

甲基甘油酸（MMA）的升高是由参与MMA代谢的遗传缺陷产生的。MMA是集体称为甲基醛酸血症的疾病组的特定诊断标志物，其包括至少7种不同的互补基团。其中两个（mut0和mut-）反映了由诱导变异在蛋白基因中的致病变体引起的酶甲基甘油基-COA变异酶的缺陷（mut）。另外两种疾病（CBLA和CBLB）与腺苷钴胺素（CBL）合成途径的异常有关。CBLC，CBLD和CBLF缺陷导致腺苷和甲基钴胺的合成受损。

自1967年首次报道这种疾病以来，全世界已确诊数百例。新生儿筛查发现，每3万名活产儿中约有1人患有甲基丙二酸血症。最常见的临床表现是新生儿或婴儿代谢性酮症酸中毒、发育迟缓和发育迟缓。过量的蛋白质摄入可能导致危及生命的代谢失代偿发作，除非密切监测治疗，包括血浆和尿液MMA水平(MMAP /甲基丙二酸，定量，血浆和MMAU /甲基丙二酸，定量，尿液)，否则仍是终身风险。

血浆酰基肉碱profile (ACRN /酰基肉碱，定量，血浆)，血浆氨基酸定量(AAQP /氨基酸，定量，血浆)，尿液有机酸(非统组织/有机酸筛选，尿液)，和同型半胱氨酸(hysp /同型半胱氨酸，总，血浆或hyss /同型半胱氨酸，总，血浆或hyss /同型半胱氨酸，总，血清)推荐用于筛查甲基丙二酸血症患者的一级生化检查。

一个全面的基因图谱是一个有用的工具，以建立一个有针对性的诊断患者的临床和生化特征的甲基丙二酸血症。

当量身定制到特定类型的甲基羟基酸血症时，治疗最有效。例如，肠腔注射的含钙霉素在CBL C的治疗中至关重要，而口服氰基胺对甲基醛酸亚胺亚型以及其他Cobalamin亚型有效。甲基丙酮醛酸的急性治疗包括透析和氮气清除剂的施用以减少氨浓度。慢性管理通常涉及限制膳食蛋白质，具有必需氨基酸补充剂。最近，肝移植成功地治疗了一些患者。

将提供解释性报告。

根据美国医学遗传学和基因组学学院(ACMG)的建议，对所有检测到的变异进行评估。(1)根据已知、预测或可能的致病性对变异进行分类，并报告解释性评论，详细说明它们的潜在或已知意义。

临床相关性:

测试结果应在临床调查结果，家族史和其他实验室数据的背景下解释。如果提供的信息不准确或不完整，则可能会出现对结果的误解。

如果检查是由于有临床意义的家族史而进行的，那么首先检查受影响的家庭成员往往是有用的。在受影响的家庭成员中发现可报告的变异将有助于对危险个体进行更有信息的检测。

为了讨论进一步检测选项的可用性，为一般检测选择提供帮助，或为这些结果的解释提供帮助，可以联系梅奥诊所实验室的遗传顾问，电话800-533-1710。

技术限制：

下一代测序可能无法检测所有类型的基因组变体。在极少数情况下，可能发生假阴性或假阳性结果。对于某些目标区域，覆盖的深度可以是可变的，但是将注意到测量性能低于最小可接受标准或失败的区域。鉴于这些限制，阴性结果不排除遗传症的诊断。如果怀疑特定的临床疾病，则可以考虑通过替代方法的评估。

如果患者具有同种异体造血干细胞移植或最近的异源输血，则由于供体DNA的存在，这些结果可能是不准确的。致电Mayyabo208o Clinic Laboratories，用于测试接受骨髓移植的患者的说明。

可能存在由于测定的技术限制而无法有效地扩增的基因区域，用于测序或缺失和重复分析，包括同源性，高鸟嘌呤 - 胞嘧啶（GC）含量和重复序列的区域。选择选择可报告变体的确认将由基于内部实验室标准的替代方法进行。

该测定不会可靠地检测40或更多碱基对（BP）的插入/缺失（吲哚），包括ALU插入，长三个核心元素（线），以及短的穿插核心元素（锡）。验证生物信息学软件管道，以检测高达75 BP的95％的删除，也可以插入47 bp。

另外，可能无法检测到低水平的马赛克变体。

该测试不设计用于区分体细胞和种系变体。如果有可能任何检测到的变体是体细胞的，则可能需要额外的测试来澄清结果的意义。

重新分类变体 - 政策：

此时，实验室没有规则地审查先前分类的变体的标准做法。实验室鼓励医疗保健提供者随时与实验室联系，以了解特定变体的地位如何随时间变化。

变体评估：

变异的评估和分类采用美国医学遗传学和基因组学学院(ACMG)和分子病理学协会(AMP)的建议作为指导方针。其他基因特异性指南也可以考虑。变异是根据已知的、预测的或可能的致病性进行分类的，并以解释性注释详细说明其潜在的或已知的意义。分类为良性或可能良性的变异没有报告。

硅评估工具中的多个可用于帮助解释这些结果。在Silico评估工具中的预测准确性高度依赖于给定基因可用的数据，并且对这些工具的定期更新可能导致预测随时间变化。来自Silico评估工具的结果应谨慎和专业的临床判断解释。没有报道未预测剪接或以其他方式有助于疾病的内含内序列变体。

1.Richards S, Aziz N, Bale S，等:解释序列变异的标准和指南:美国医学遗传学和基因组学学院和分子病理学协会的联合共识建议。Genet Med. 2015 May;17(5):405-424

2.Fenton WA，砾石RA, Rosenblatt DS:丙酸和丙二酸甲酯代谢紊乱。见:Valle D, Antonarakis S, Ballabio A, Beaudet A, Mitchell GA，编。遗传疾病的在线代谢和分子基础。麦格劳-希尔教育;2019.2020年1月7日生效。http://ommbid.mhmedical.com/content.aspx?bookid=2709§ionid=225086103

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