测试ID: KETGP
酮类疾病基因图谱，各不相同

随访异常生化结果提示酮类疾病

建立酮类疾病患者的分子诊断

识别已知与酮类疾病相关的基因变异，以便对有风险的家庭成员进行预测检测

该测试利用下一代测序来检测与酮类疾病相关的9个基因的单核苷酸和拷贝数变异:ACAA2，ACAT1，ACAT2，AKT2，BDH1，HMGCL，HMGCS2，OXCT1，SLC16A1．有关更多细节，请参见方法描述。

致病变异的鉴定可能有助于酮类疾病的诊断、预后、临床管理、家族筛查和遗传咨询。

可能会考虑/建议进行额外的一级测试。有关更多信息，请参见咨询信息。

酮是葡萄糖低时组织使用的化学能源。酮体代谢障碍包括-酮硫醇酶(BKT)缺乏和琥珀酰辅酶a:3-酮酸辅酶a转移酶(SCOT)缺乏。酮生成障碍是线粒体3-羟基-3-甲基戊二酸辅酶a (HMG-CoA)合酶(mHS)和HMG-CoA裂解酶(HL)缺失。

BKT缺乏是由乙酰乙酰辅酶a硫代酶活性受损引起的。BKT缺乏的个体在出生时通常无症状，症状可能在6至18个月时因疾病或禁食而发展，表现为失代偿期和严重的酮症酸中毒、呕吐、脱水和嗜睡。儿童在发作之间通常无症状。

SCOT缺乏是一种更严重的酮类利用障碍，因为所有人都经历反复的酮酸中毒发作，大多数人有慢性酮中毒。约50%的SCOT缺乏症婴儿出现在出生后的第一周，其余50%出现在6至24个月之间。

线粒体酶mHS活性降低是mHS缺乏的原因。mHS缺乏的婴儿会出现低酮血症低血糖发作，可发展为昏迷。在mHS缺乏症中，尿中有机酸没有诊断模式。唯一的生化诊断方法是肝中mHS的酶测定。

HL缺乏是由于线粒体和过氧化物酶体酶HL活性降低。患有HL缺乏症的婴儿和儿童也会经历酮症低血糖发作，这些发作的长期影响包括癫痫、智力残疾和脑白质改变，通常是由低血糖引起的。HL患者的尿液有机酸具有特征性，并显示出高水平的HMG和亮氨酸代谢物。

所有4种酮类疾病都是常染色体隐性遗传。BKT缺陷是由ACAT1， SCOT缺陷是由OCT1．HMG-CoA合酶缺乏是由于HMGCS2， HMG-CoA裂解酶缺乏是由于在HMGCL．

另一种影响酮代谢的疾病是单羧酸转运体1缺乏，这是由2种突变引起的SLC16A1并导致严重的酮症酸中毒，伴随疾病或禁食。

这些酮类疾病的治疗包括避免禁食和提供口服或静脉碳水化合物以纠正低血糖和酮酸中毒。长期神经后遗症发生在某些个体，是酮症酸中毒发作期间低血糖的后果。

尿液有机酸(非统组织/有机酸筛选，随机，尿液)和血浆酰基肉碱(ACRN /酰基肉碱，定量，血浆)是评估酮类疾病的推荐一级试验。然而，由于这些可能是正常的，但严重的BKT缺乏，分子基因检测是一个快速和有效的工具，以诊断个人酮障碍。

将提供一份解释性报告。

根据美国医学遗传学和基因组学学院(ACMG)的建议，对所有检测到的变异进行评估。(1)根据已知、预测或可能的致病性对变异进行分类，并报告解释性评论，详细说明它们的潜在或已知意义。

临床相关性:

检测结果应结合临床表现、家族史和其他实验室数据进行解释。如果提供的信息不准确或不完整，可能会导致对结果的误解。

如果检查是由于有临床意义的家族史而进行的，那么首先检查受影响的家庭成员往往是有用的。在受影响的家庭成员中发现可报告的变异将有助于对危险个体进行更有信息的检测。

为了讨论进一步检测选项的可用性，为一般检测选择提供帮助，或为这些结果的解释提供帮助，可以联系梅奥诊所实验室的遗传顾问，电话800-533-1710。

技术的局限性:

下一代测序可能无法检测到所有类型的基因组变异。在极少数情况下，可能会出现假阴性或假阳性结果。对于某些靶区，覆盖深度可能是可变的，但检测性能低于最低可接受标准或失败区域将被注意到。鉴于这些局限性，阴性结果并不排除遗传疾病的诊断。如果怀疑有特定的临床疾病，可以考虑采用其他方法进行评估。

如果患者曾接受过异基因造血干细胞移植或最近的异体输血，这些结果可能由于捐献者DNA的存在而不准确。请致电梅奥yabo208诊所实验室，了解如何对接受骨髓移植的病人进行检测。

由于检测技术的限制，可能存在基因区域无法有效扩增用于测序或缺失和重复分析，包括同源区域、高鸟嘌呤-胞嘧啶(GC)含量和重复序列。根据内部实验室标准，采用替代方法对选定的可报告变型进行确认。

该方法不能可靠地检测40个或更多碱基对(bp)的插入/缺失(indels)，包括Alu插入、长核杂散元素(LINES)和短核杂散元素(SINES)。生物信息学软件管道被证实可以检测95%的75 bp以下的缺失和47 bp以下的插入。

此外，低水平的镶嵌变体可能无法检测到。

这个测试不是为了区分体细胞变异和种系变异。如果有可能任何检测到的变异是体细胞，可能需要额外的检测来澄清结果的重要性。

Variants-Policy重新分类:

目前，实验室定期系统地审查以前分类过的变种还不是标准做法。实验室鼓励卫生保健提供者随时与实验室联系，以了解某一特定变体的状态随时间的变化情况。

变体的评估:

根据美国医学遗传学和基因组学学院(ACMG)和分子病理学协会(AMP)的建议，评估和分类变异。(1)其他基因特异性指南也可以考虑。变异是根据已知的、预测的或可能的致病性进行分类的，并以解释性注释详细说明其潜在的或已知的意义。分类为良性或可能良性的变异没有报告。

多种硅评价工具可用于帮助解释这些结果。硅评估工具预测的准确性高度依赖于给定基因的可用数据，定期更新这些工具可能会导致预测随着时间的推移而改变。从硅评估工具的结果应解释谨慎和专业的临床判断。未预测会影响剪接或导致疾病的内含子和同义序列变异尚未报道。

1.Richards S, Aziz N, Bale S，等:解释序列变异的标准和指南:美国医学遗传学和基因组学学院和分子病理学协会的联合共识建议。Genet Med. 2015 May;17(5):405-424。

2.王志强，王志强:酮体代谢的先天性错误。在:Valle D, Antonarakis S, Ballabio A, Beaudet A, Mitchell GA。eds。遗传疾病McGraw-Hill教育的在线代谢和分子基础2019.2020年1月07年,通过。可以在http://ommbid.mhmedical.com/content.aspx?bookid=2709§ionid=225087757

3.等:酮体利用的先天错误。Pediatr Int。2015;(1):57 41-48

4.田志强，田志强，田志强:酮体代谢及其缺陷。[J] .遗传医学杂志。2014;37(4):541-551

• 分子遗传学:生化疾病患者信息
• 基因检测的知情同意
• 基因检测的知情同意(西班牙语)