测试ID: DHCRZ
史密斯Lemli Optiz,DHCR7基因，全基因分析，变化

跟进异常的生化结果暗示史密斯-LEMLI-opitz综合征

建立Smith-Lemli-Opitz综合征患者的分子诊断

确定改变内DHCR7允许对有风险的家庭成员进行预测性检测

该测试利用下一代测序来检测与Smith Lemli Opitz (SLO)综合征相关的1个基因的单核苷酸和拷贝数变异。

鉴定致病变异可以有助于诊断，预后，临床管理，家族性筛查和SLO综合征的遗传咨询。

可能会考虑/建议进行额外的一级测试。有关更多信息，请参见订购指南。

胆固醇在许多细胞和发育过程中起着重要作用。除了作为膜脂质的作用外，它是许多分子的前体，这些分子在细胞生长和分化，蛋白质糖基化和信号通路中起重要作用。胆固醇的生物合成及其随后转化对其他必需化合物是复杂的，涉及许多中间体和酶。由这些酶的缺乏导致的疾病导致特异性中间体的积累并抑制重要的生物分子的形成。胆固醇生物合成障碍常见的临床发现包括先天性骨骼畸形，疑难生面部特征，精神抑制和未能茁壮成长。

史密斯-LEMLI-opitz综合征（SLO）是由改变引起的常染色体隐性疾病DHCR7基因导致缺乏7-脱氢胆固醇还原酶。它的生物化学特征是7-脱氢胆固醇(7-DHC)和8-脱氢胆固醇(8-DHC)水平显著升高。临床上的特征包括小头畸形、生长迟缓、发育迟缓、面部畸形、腭裂、肢体异常(特别是2-3趾并指和轴后多指)以及心脏和肾脏畸形。临床范围从轻到重，一些轻度患者仅表现为2至3趾并指和轻度认知障碍。

SLO以常染色体隐性方式遗传，由两位等位基因中的致病变体引起DHCR7基因。报道的发病率在2万分之一到4万分之一之间，但由于对轻度患者的诊断不足，它可能更为普遍。

血浆中胆固醇前体的测量(SLO/ Smith-Lemli-Opitz Screen, plasma)应作为筛查SLO的一级试验。

胆固醇补充可能导致临床改善，但不是治愈性的。

将提供解释性报告。

根据美国医学遗传学和基因组学学院(ACMG)的建议，对所有检测到的变异进行评估。(1)根据已知、预测或可能的致病性对变异进行分类，并报告解释性评论，详细说明它们的潜在或已知意义。

临床相关性：

检测结果应结合临床表现、家族史和其他实验室数据进行解释。如果提供的信息不准确或不完整，可能会导致对结果的误解。

如果检查是由于有临床意义的家族史而进行的，那么首先检查受影响的家庭成员往往是有用的。在受影响的家庭成员中发现可报告的变异将有助于对危险个体进行更有信息的检测。

为了讨论附加检测选项的可用性，为一般检测选择提供帮助，或为这些结果的解释提供帮助，可以联系梅奥诊所实验室的遗传顾问，电话800-533-1710。

技术限制：

下一代测序可能无法检测到所有类型的基因组变体。在极少数情况下，可能发生假阴性或假阳性结果。对于某些目标区域，覆盖的深度可能是可变的，但是将注意到低于最小可接受标准或失败区域的测定性能。鉴于这些限制，阴性结果不排除遗传症的诊断。如果怀疑特定的临床疾病，则可以考虑通过替代方法的评估。

如果患者具有同种异体造血干细胞移植或最近的异源输血，则由于供体DNA的存在，这些结果可能是不准确的。致电Mayyabo208o Clinic Laboratories，用于测试接受骨髓移植的患者的说明。

由于测定的技术限制，可能存在不能有效地扩增的基因区域，以便测序或缺失和重复分析，包括同源性，高鸟嘌呤 - 胞嘧啶（GC）含量和重复序列的区域。选择选择可报告变体的确认将由基于内部实验室标准的替代方法进行。

该方法不能可靠地检测40个或更多碱基对(bp)的插入/缺失(indels)，包括Alu插入、长核杂散元素(LINES)和短核杂散元素(SINES)。生物信息学软件管道被证实可以检测95%的75 bp以下的缺失和47 bp以下的插入。

另外，可能无法检测到低水平的马赛克变体。

该测试不设计用于区分体细胞和种系变体。如果有可能任何检测到的变种是体细胞的，则可能需要额外的测试来澄清结果的重要性。

重新分类变体 - 政策：

此时，实验室没有规则地审查先前分类的变体的标准做法。实验室鼓励医疗保健提供者随时与实验室联系，以了解特定变体的地位可能随着时间的推移而变化。

变体评估：

根据美国医学遗传学和基因组学学院(ACMG)和分子病理学协会(AMP)的建议，评估和分类变异。(1)其他基因特异性指南也可以考虑。变异是根据已知的、预测的或可能的致病性进行分类的，并以解释性注释详细说明其潜在的或已知的意义。分类为良性或可能良性的变异没有报告。

多种硅评价工具可用于帮助解释这些结果。硅评估工具预测的准确性高度依赖于给定基因的可用数据，定期更新这些工具可能会导致预测随着时间的推移而改变。从硅评估工具的结果应解释谨慎和专业的临床判断。未预测会影响剪接或导致疾病的内含子和同义序列变异尚未报道。

1.Richards S, Aziz N, Bale S，等:解释序列变异的标准和指南:美国医学遗传学和基因组学学院和分子病理学协会的联合共识建议。Genet Med. 2015 May;17(5):405-424

2. Haas D，Herman Ge，Hoffmann GF：胆固醇生物合成的缺陷。在：Sarafoglou K，Hoffman GF，Roth Ks，EDS。小儿内分泌和新陈代谢的天生误差。第二辑。麦格劳山教育;2017年：413-426

3.Nowaczyk MJM, Wassif CA: Smith-Lemli-Opitz综合征。见:Adam MP, Ardinger HH, Pagon RA等编。GeneReviews[网络]。华盛顿大学西雅图分校;1998.2020年1月30日更新。2020年10月27日生效。可以在www.ncbi.nlm.nih.gov /书/ NBK1143 /

4.Hall P, Michels V, Gavrilov D，等:阿立哌唑和曲唑酮导致无Smith-Lemli-Opitz综合征患者的7-脱氢胆固醇升高。(1-2):176-178

• 分子遗传学：生物化学障碍患者信息
• 知情同意遗传测试
• 基因检测的知情同意(西班牙语)