测试ID: BTWGS
细菌分型，全基因组测序，各不相同

协助调查一种细菌可能爆发的疾病

可能有助于识别个别患者的复发性感染

需要生物体鉴定。所有提交的细菌都将进行检测。不正确或不完整的生物体鉴定可能导致最终分析没有结果。实验室可以进行基质辅助激光解吸/电离飞行时间质谱(MALDI-TOF MS)或反射测试中列出的其他测试，以确认识别，报告发现，并相应收费。

当需要对之前提交的分离株进行再分析以与新分离株进行比较时，梅奥诊所实验室将添加生物信息学再分析。yabo208必须提供原始患者提交信息(姓名和订单号)。

在可能发生医院传播或社区暴发的情况下，菌株分型可能有助于确定菌株的相关性。从同一患者获得的连续分离株可以进行分型以评估相似性。分型可以区分同一物种的2个或更多的分离株，这可以为识别疾病暴发、医院传播或确定单个患者的潜在传染源提供信息。

脉冲场凝胶电泳(PFGE)传统上用于菌株分型，但并不总是区分不同的菌株(例如，2个基因不同的菌株可能具有无法区分的PFGE模式)。全基因组测序比PFGE提供了更高水平的菌株遗传相关性分辨率。

据报道，分离是“相关的”、“可能相关的”或“不相关的”。

将确定单个分离株的基因组序列，并与其他共同提交的分离株的基因组序列进行比较。该报告将显示分离菌株之间的亲缘程度。解释性报告的链接将发送到客户提供的注册电子邮件地址。

基因组相关性并不能证明被检测的细菌分离物与流行病学相关。建立流行病学关系需要与临床和流行病学信息相关联。如果在具有高度遗传相关性的菌株的患者之间能够建立共同接触，就可能归因于流行病学的联系。与其他类型的菌株分型(如脉冲场凝胶电泳:PFGE)类似，基于序列的菌株分型在显示遗传差异方面最有力，降低了菌株共享相似来源的可能性。

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