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测试ID: BTWGS
细菌分型,全基因组测序,各不相同

方法描述描述如何执行测试,并提供特定于方法的参考

在MiSeq (Illumina)上对每个提交的分离株进行全基因组测序后,将使用SeqSphere+软件(Ridom GmbH)进行核心基因组多位点序列分型(MLST)分析,对序列进行比较。等位基因图谱将用于生成显示分离亲缘关系的系统发育树。(Leopold SR, Goering RV, Witten A等:重新审视细菌全基因组测序:便携式、可扩展和标准化的分析,用于毒力和抗生素耐药性基因的分型和检测。临床微生物学杂志。2014年7月;52[7]:2365-2370)

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没有

天(s)列出进行测试的天数。这一范围反映了样品必须在测试实验室开始测试过程的日期,包括测试执行前的任何样品准备和处理时间。有些检测被列为连续进行的,这意味着在一天中进行多次检测。

每周

报告可用时间间隔(从梅奥诊所实验室收到样本到获得结果)考虑到标准设置日和周末。yabo208第一天通常是结果可用的时间。最后一天是可能需要的时间,包括任何必要的重复测试。

30 - 40天

样品保留时间概述测试后标本在实验室中保存的时间,然后将其丢弃

1个月

执行实验室的位置指示执行测试的实验室的位置

罗彻斯特