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在不明原因的突然死亡和怀疑长QT或Brugada综合征的情况下提供尸检基因评估
鉴定死者的致病变异,这可能有助于危险家庭成员的风险评估和预测测试
该测试包括下一代测序和补充Sanger测序来评估Akap9, ank2, cacna1c, cacna2d1, cacnb2, cav3, gpd1l, kcne1, kcne2, kcne3, kcnh2, kcnj2, kcnj5, kcnj8, kcnq1, scn1b, scn3b, scn4b, scn5a,SNTA1基因。
据估计,在北美和欧洲每年每10万人中有50至100人发生心脏性猝死(SCD),在美国每年夺走25万至45万人的生命。在年轻人(15-35岁)中,SCD的发病率为每10万年轻人中1 - 2例。SCD的报告发病率可能被低估了,因为更明显的死亡原因,如车祸和溺水,可能是由致心律失常事件造成的。在死因不明的猝死案例中,如果尸检没有发现猝死的结构基础,则可能怀疑是遗传性心律失常。Brugada综合征(BrS)和长QT综合征(LQTS)是可导致心源性猝死的遗传型心律失常。对遗传性心律失常的尸检诊断可能有助于确认死亡原因和方式,以及对在世家庭成员的风险评估。
BrS是一种以心电图(EKG) V1-V3导联ST段抬高为特征的遗传性心脏疾病,是室性心律失常的高危疾病,可导致心源性猝死。BrS是常染色体显性遗传,是由编码心脏离子通道的致病基因变异引起的。BrS的诊断是基于特征性的心电图异常以及个人和家族病史,同时需要排除心脏结构异常、药物、电解质失衡等其他原因。与BrS相关的基因包括Cacna1c, cacna2d1, gpd1l, kcne3, kcnj8, scn3b, cacnb2, scn1b,SCN5A。MCL的BRGGP / Brugada综合征多基因面板,血液测试中可以找到BrS的其他临床信息。
LQTS是一种以QT间期延长和心电图t波异常为特征的遗传性心脏疾病,可导致复发性晕厥、室性心律失常和心源性猝死。罗马诺-沃德综合征(RWS)占LQTS的大多数,遵循常染色体显性遗传模式,由编码心脏离子通道或相关蛋白的基因致病性变异引起。RWS的诊断是在没有其他可能延长QTc间隔的条件或因素(如延长qt的药物或结构性心脏异常)的情况下,通过延长QTc间隔确定的。临床因素如晕厥史和家族史也有助于RWS的诊断。LQTS也可能与先天性双侧深度感音神经性听力损失有关,这种情况被称为Jervell和langer - nielsen综合征(JLNS)。JLNS是一种常染色体隐性遗传模式,是由纯合子或复合杂合子致病变异引起的KCNQ1或KCNE1基因。蒂莫西综合征(TS)是一种多系统疾病,涉及延长QT间期与先天性异常。TS是一种常染色体显性遗传方式,通常发生在一个新的杂合子变异CACNA1C基因。与LQTS相关的基因包括Akap9, ank2, cacna1c, cav3, kcne1, kcne2, kcnh2, kcnj2, kcnj5, kcnq1, scn4b, scn5a,和SNTA1.有关LQTS的其他临床信息可在MCL的ID LQTGP /长QT综合征多基因面板,血液测试中找到。
将提供一份解释性报告。
变异的评估和分类使用最新出版的美国医学遗传学学院的建议作为指导方针。变异是根据已知的、预测的或可能的致病性进行分类的,并以解释性注释详细说明其潜在的或已知的意义。
多种硅评价工具可用于帮助解释这些结果。硅评估工具做出的预测的准确性高度依赖于给定基因的可用数据,这些工具做出的预测可能会随着时间而改变。从硅评估工具的结果应解释谨慎和专业的临床判断。
样品质量:
当没有EDTA全血,只有福尔马林固定、石蜡包埋(FFPE)组织或血点可用时,可使用此测试。从FFPE组织中提取的DNA可以降解,这导致与从全血中提取的DNA相比,下一代测序的失败率更高(约5%)。由于从FFPE中提取的DNA的质量,可接受的覆盖阈值低于等效的血液检测。预计所有评估区域的覆盖率至少为40倍,但可由实验室主任酌情根据具体情况进行调整。桑格测序可用于未达到这一覆盖率的区域,由实验室主任决定。未被充分覆盖的基因组区域将在实验室报告中注明。与从血液中提取的DNA相比,桑格对FFPE提取的DNA进行测序也可能导致质量限制。
临床相关性:
一些参与了面板上的1个或多个基因的个体可能具有一种不能被所使用的方法识别的变异(如启动子突变、深度内含子突变)。因此,没有变异并不排除长QT综合征、Brugada综合征或相关疾病的可能性。
检测结果应结合临床表现、家族史和其他实验室数据进行解释。如果提供的信息不准确或不完整,可能会导致对结果的误解。
如果进行检查是因为有长QT综合征、Brugada综合征或相关疾病的家族史,通常首先检查受影响的家庭成员是有用的。在受影响个体中识别致病变异可以对风险个体进行信息更丰富的检测。
技术的局限性:
下一代测序可能无法检测到所有类型的遗传变异。此外,罕见变异可能会导致假阴性或假阳性结果。如果结果与临床结果不一致,考虑其他方法来分析这些基因。
对于血点样本:如果患者曾进行过异基因血液或骨髓移植,或最近(即,在采集样本后6周内)输过异种血,由于捐献者DNA的存在,结果可能不准确。
变体的重新分类策略:
目前,实验室系统地审查检测和报告的可能致病变异或意义不确定的变异,还不是标准做法。实验室鼓励卫生保健提供者随时与实验室联系,以了解某一特定变体的状态随时间的变化情况。
如果需要用于分析该患者结果的转录本或人类基因组组装的额外信息,请与实验室联系。
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