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测试ID: SMNDX
脊髓性肌肉萎缩诊断分析,缺失/重复分析,各不相同

有用的建议临床疾病或测试可能有帮助的环境

新生儿脊髓性肌萎缩症(SMA)的一线筛查

SMA产前检查

诊断测试以确认疑似的SMA诊断

遗传学测试信息提供有助于选择正确基因检测或正确提交检测请求的信息

确定SMN1外显子7拷贝数和SMN2外显子7拷贝数。还确定G . 27134t >G改变在发现有2个拷贝的患者中是否存在SMN1

测试算法描述将测试添加到初始顺序时的情况。这包括反射和其他测试。

只适用于产前标本:如果接受了羊水(非融合培养细胞),将额外收费进行羊水培养/基因检测。

如果收到绒毛膜绒毛标本(非融合培养的细胞),将按实验室规程添加用于基因检测的成纤维细胞培养物,并另行收费。

对于收到的任何产前样本,将根据实验室规程增加母体细胞污染检测,并收取额外费用。

有关更多信息,请参见新生儿筛查法案表脊髓肌萎缩:零功能副本SMN1在特殊的指令。

以下算法可在特殊说明:

-遗传运动神经元疾病检测算法

-新生儿脊髓性肌萎缩筛查随访

临床信息讨论生理学,病理生理学和一般的临床方面,因为他们涉及一个实验室测试

脊髓性肌萎缩症(SMA)是一种常染色体隐性神经肌肉疾病,以运动神经元变性导致肌肉萎缩并进行性瘫痪为特征。它是一种遗传上复杂的疾病,传统上分为5个亚型,取决于症状出现的年龄和达到的运动里程碑。表现范围从子宫关节挛缩和胎儿运动缺乏(0型)到青春期或成年期失去行走能力(IV型)。所有SMA患者都出现肌肉控制的对称性丧失,最常见的是近端肌肉。美国医学遗传学和基因组学学院(ACMG)和美国妇产科医师大会(ACOG)目前建议对所有夫妇在怀孕前或怀孕早期进行SMA携带者筛查,不论种族或民族。

SMA最常见的形式与存活运动神经元(SMN)蛋白的丢失有关,该蛋白由5号染色体上的2个或更多基因编码。大多数SMN蛋白是由SMN1基因,但一小部分SMN也由SMN2基因。事实上,SMN1产生超过90%的SMN蛋白,而SMN2产生不到10%的残余SMN蛋白。这是因为SMN2不同于SMN1通过5个核苷酸的改变,其中一个导致了替代的外显子7剪接,并减少SMN2表达式。大多数人有两份SMN1,但有多达5个副本的个体SMN1曾被观察到。此外,个人也可拥有0至5份副本SMN2

SMA最常见的是由纯合外显子7缺失引起的SMN1.然而,有些患者可能是复合杂合子,缺失1个拷贝SMN1和另一个等位基因的点变化。病人病情的严重程度与病毒的数量有关SMN23个或3个以上SMN2拷贝与更温和的SMA表型相关。

由于SMA试验是一种定量分析数量的方法SMN1第7外显子缺失,任何结果显示2个或更多SMN1事实上,副本可以有两份副本SMN1在顺式(在同一染色体上)和一个副本SMN1另一条染色体上的外显子7缺失(反式)。这被称为“2+0”载体基因型。“2+0”携带者基因型的频率因血统不同而不同。以前,不可能区分“2+0”携带者和只有一个拷贝的个体SMN1在每一个染色体。然而,根据Luo等人进行的一项研究,(1)现在有可能提供一种针对一个人的祖先的调整遗传残留携带者风险,基于存在或不存在SMN1变更g.27134T > G。这种变化的存在与德系犹太人和亚洲人口中的“2+0”携带者有关,它增加了一个人在其他人口中是“2+0”携带者的几率。详见下表。

SMA载波剩余风险估计(1)

祖先

载波频率

仅基于拷贝数的检测率

检测后残留风险2份SMN1

检出率加SMN1g.27134T > G

缺乏后作为2+0携带者的剩余风险SMN1g.27134T > G

2+0携带者存在后的残留风险SMN1g.27134T > G

德系犹太人

1在41.1

90%

在345年1

94%

在580年1

2 + 0载体

亚洲

1在53个

92.6%

在628年1

93.3%

1在701.8

2 + 0载体

非裔美国人

在66年1

71.1%

在121年1

N/A

1在395.7

1在33.5

拉美裔

在117年1

90.6%

在1061年1

N/A

在1762年1

1在139.6

高加索人

1在35

94.9%

在632年1

N/A

1在769.3

1在28.6

参考价值描述用于解释测试结果的参考间隔和附加信息。可能包括基于年龄和性别的间隔时间。间隔是mayo派生的,除非另有指定。如果提供了解释性报告,参考值字段将说明这一点。

将提供一份解释性报告。

解释提供有助于解释测试结果的信息

将提供一份解释性报告。

注意事项讨论可能导致诊断混乱的条件,包括不适当的标本采集和处理,不适当的试验选择和干扰物质

点突变是不可检测的。该分析也不能明确区分2个存活运动神经元副本1 (SMN1),而大多数祖先的患者在不同的染色体上有2个拷贝。

存在可能导致假阴性或假阳性结果的罕见多态性。如果获得的结果与临床结果不一致,则应考虑进行额外的检测。

检测结果应结合临床表现、家族史和其他实验室数据进行解释。如果给出的信息不准确或不完整,我们对结果的解释可能会出现错误。

临床参考临床性质的深入阅读的建议

1.罗敏,刘玲,Peter I,等:一种复制等位基因特异性的德系犹太人SMN1单倍型提高了对脊柱肌肉萎缩的泛民族携带者筛查。麝猫医学。2014;16:149 - 156。doi: 10.1038 / gim.2013.84

2.Hendrickson BC, Donohoe C, Akmaev VR,等:北美各种族间SMN1等位基因频率的差异。J Med Genet. 2009;46:641-644。doi: 10.1136 / jmg.2009.066969

3.Carre A, Empey C:产前和儿童遗传顾问对脊髓性肌萎缩症(SMA)的回顾。J Genet Couns. 2016;25:32-43。doi: 10.1007 / s10897 - 015 - 9859 - z

4.遗传学委员会:委员会意见第690号:基因组医学时代的携带者筛查。比较。Gynecol。2017;129:e35-e40。doi: 10.1097 / AOG.0000000000001951

5.遗传委员会:委员会意见第691号:遗传条件的载体筛选。比较。Gynecol。2017年3月,129;e41-e55。doi: 10.1097 / AOG.0000000000001952

6.D’amico A, Mercuri E, Tiziano FD, Bertini E:脊髓性肌肉萎缩。《罕见病》2011;6:71。doi: 10.1186 / 1750-1172-6-71

7.脊髓性肌肉萎缩:分子诊断方法综述。Curr Protoc Hum Genet. 2016;1:88单元9.27。hg0927s88 doi: 10.1002/0471142905.

8.之前TW, Nagan N, Sugarman EA, Batish SD, Braastad C:脊柱肌肉萎缩测试的技术标准和指南。麝猫地中海,2011;13:686 - 694。doi: 10.1097 / GIM.0b013e318220d523

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