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测试ID: PGXQP
聚焦药物基因组学小组,各不相同

方法描述描述如何执行测试,并提供特定于方法的参考

基因组DNA是从全血或唾液中提取的。使用基于聚合酶链反应(PCR)的5'-核酸酶分析对每个等位基因进行基因分型。荧光标记的检测探针对目标DNA进行退火。PCR用于扩增含有变异基因的DNA片段。如果检测探针与目标DNA完全匹配,5'-核酸酶聚合酶降解探针,报告染料从猝灭染料的影响中释放出来,并检测到荧光信号。基因型是根据检测到的等位基因特异性荧光信号来分配的。使用手册:TaqMan SNP基因分型分析用户指南。应用生物系统公司;修订格01/2014)

CYP2D6拷贝数检测:

本分析采用双链实时荧光定量PCR,每个反应包含一个拷贝数探针和一个参考分析。每个拷贝数探针检测感兴趣的基因组序列,参考分析检测已知存在于二倍体基因组中的2个拷贝中的序列。相对定量用于确定每个探针归一化至10 ng/mcL的基因组DNA (gDNA)样品中感兴趣目标的相对拷贝数。每个探针都归一化到参考序列的已知副本编号,并与每次运行中包含目标序列的已知副本的校准样品进行比较。(包装插入:Taqman拷贝数测定。应用生物系统公司;版本B)

2D6测序分析(第2层,根据需要):

CYP2D6通过PCR扩增感兴趣的等位基因。PCR产物然后用荧光染料终结者化学方法纯化并在两个方向进行测序。测序产品在自动测序仪上分离,跟踪文件使用突变检测软件和目视检查分析所有9个外显子的外显子和内含子/外显子边界的变化。(未发表的梅奥法)

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补充再保险

天(s)列出进行测试的天数。这一范围反映了样品必须在测试实验室开始测试过程的日期,包括测试执行前的任何样品准备和处理时间。有些检测被列为连续进行的,这意味着在一天中进行多次检测。

星期一到星期五

报告可用时间间隔(从梅奥诊所实验室收到样本到获得结果)考虑到标准设置日和周末。yabo208第一天通常是结果可用的时间。最后一天是可能需要的时间,包括任何必要的重复测试。

3 - 14天

样品保留时间概述测试后标本在实验室中保存的时间,然后将其丢弃

全血/唾液拭子:2周;提取DNA: 2个月

执行实验室的位置指示执行测试的实验室的位置

罗彻斯特