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测试ID:PANCP
遗传性胰腺癌面板各不相同

方法描述描述如何执行测试并提供特定于方法的参考

进行下一代测序(NGS)和/或Sanger测序,以测试分析基因的编码区域和内含子/外显子边界的存在,以及一些已知的致病变体的其他区域。人类基因组参考GRCH37/HG19构建用于序列读取。至少99%的基础覆盖在30倍以上的读取深度。对于单核苷酸变体的敏感性估计高于99%,插入/缺失(indels)小于40碱基对(BP)的敏感性高于94%,高达75 bp的缺失且插入高达47 bp的95%以上。NGS,多重连接依赖性探针扩增(MLPA),和/或基于聚合酶链反应(PCR)的定量方法,以测试分析基因中缺失和重复的存在。进行PCR和凝胶电泳以测试是否存在10兆瓦的倒置,编码外显子1-7MSH2基因。有关每个测试分析的靶向基因的详细信息,请参见遗传性胰腺癌小组的靶向基因和方法论细节在特殊说明中。

由于测定的技术局限性,包括同源性区域,高鸟嘌呤 - 酪氨酸(GC)含量和重复序列,可能有一些基因区域无法通过测序或缺失和重复分析来有效评估。有关特定基因区域未经常涵盖的详细信息,请参见遗传性胰腺癌小组的靶向基因和方法论细节在特殊说明中。

根据内部实验室标准,可以通过替代方法进行确认。(未发表的Mayo方法)

分析的基因:ATM,BRCA1,BRCA2,CDKN2A,EPCAM(仅复制号变体),MLH1,MSH2,MSH6,PALB2,PMS2,STK11,TP53

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补充

一天表演概述了进行测试的日子。该领域反映了样品必须在测试实验室中才能开始测试过程的一天,并包括进行测试之前的任何标本准备和处理时间。一些测试被列为连续执行的,这意味着测定在白天多次执行。

变化

可用报告时间间隔(在Mayo Clinic Laboratories接收样品以可用的结果)考虑yabo208到标准的设置日和周末。第一天是结果通常需要的时间。最后一天是它可能需要的时间,考虑到任何必要的重复测试。

3至4周

标本保留时间概述了测试样品在丢弃之前将样品保存在实验室中的时间长度

全血:2周(如果有);提取的DNA:3个月

执行实验室位置指示执行测试的实验室的位置

罗切斯特