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测试ID: CFP
囊性纤维化突变分析,106突变面板,变化

有用的建议临床疾病或测试可能有帮助的环境

临床诊断为囊性纤维化的确认

通过携带者筛查风险细化为在普通人群中的个体

产前诊断或家族性变体的测试时,家族性的变体都包括在临床信息中列出的106变体面板

当没有家族突变时,通过对有家族史的个体进行携带者筛查来改善风险

确定哪些病人可能会有反应雌性生殖道增效剂治疗

遗传学测试信息提供可能有助于选择正确的遗传测试或适当提交测试请求的信息

这106种变异包括美国医学遗传学和基因组学学院(ACMG)推荐的23种变异。

测试算法在初始订单中添加测试时,描绘情况。这包括反射和额外的测试。

对于产前标本只:如果接受羊水(非融合培养细胞),将增加羊水培养/基因检测,并另行收费。如接受绒毛膜绒毛标本(非融合培养细胞),则加入成纤维细胞培养进行基因检测,并单独收费。对于任何收到的产前样本,都将添加母细胞污染研究。

看到囊性纤维化分子诊断检测算法在特殊的指令。

临床信息讨论生理学,病理生理学和一般临床方面,因为它们与实验室测试有关

囊性纤维化(Cystic fibrosis, CF)是一种严重的常染色体隐性遗传疾病,以不同程度的慢性阻塞性肺疾病和胰腺酶功能不全为特征。CF的发病率在不同的人群中有显著差异,差异筛查试验的差异检出率也是如此。迄今为止,CF基因中已经描述了超过1500个变异,命名为囊性纤维化跨膜电导调节器(雌性生殖道).最常见的变异是deltaF508,约占全球变异的67%,在北美白人群体中约占70%至75%。大多数剩余的变异是相当罕见的,尽管有些在某些种族或CF的非典型表现如先天性双侧输精管缺乏症(CBAVD)中表现出相对较高的患病率。该分析检测到的变异包括美国医学遗传学和基因组学学院推荐的23个变异以及83个其他变异。

值得注意的是,雌性生殖道增效剂疗法可以改善患者的临床结果的临床诊断CF和G178R,G551S,G551D,S549N,S549R,G1244E,S1251N,S1255P,或G1349D变体的至少一个拷贝。该G178R,S549N,S549R,S551D和S1251N变体包括在本次测试。

这些变种106占在北欧白人人口CF染色体的约91%。检测率几个民族和种族群体列于下表。需要注意的是测试结果和风险计算的解释也依赖于临床信息和家族病史。

种族或族群

载频

变异检出率*

非裔美国人

1/65

81%

德系犹太人

1/25

97%

亚裔美国人(不包括日裔)

1/90

54%

混合欧洲

1/25

82%

东欧

1/25

77%

法国加拿大人

1/25

91%

西班牙裔美国人

1/46

82%

北欧

1/25

91%

南欧

1/25

79%

价格是古典CF.价格是CF的和CBAVD非典型低。

雌性生殖道下面列出的变种包括在这个面板中。

删除外显子2-3

外显子11:R553X

内含子2:296+ 2t >a

外显子11:A559T

外显子3:E60X

外显子11:R560T

外显子3:R75X

内含子11:1811 + 1.6kb的> G

外显子3:G85E

内含子11:1812-1 G>A

外显子3:394_395delTT

内含子12:1898 + 1 G> A

内含子3:405 + 1 G> A

内含子12:1898 + 1 G> T

内含子3:406-1 G> A

内含子12:1898 + 1个G> C ^

外显子4:E92X

内含子12:1898+ 5g >T

外显子4:444菲律宾人质

外显子12:P574H

外显子4:457TAT“G

外显子13:1949 del84

外显子4:R117H

外显子13:2043 delg

外显子4:R117C

外显子13:2055del9>甲

外显子4:Y122X

外显子13:2105del13ins5

外显子4:574delA

外显子13:2108菲律宾人质

内含子4:621 + 1 G> T

外显子13:2143解决

外显子5:663解决

外显子13:2183_2184delAAinsG

外显子5:G178R

外显子13:2184delA

内含子5:711+ 1g >T

外显子13:2184年早期

内含子5:711+ 5g >a

外显子13:R709X

内含子5:712-1 G>T

外显子13:K710X

外显子6A:H199Y

外显子13:2307insA

外显子6:P205S

外显子13:R764X

外显子6:L206W

内含子14b: 2789+ 5g >A

外显子6:852 del22

外显子15:2869insG

外显子6B:935delA

外显子15:Q890X

外显子6 b: 936三角洲

内含子16:3120 + 1 G> A

外显子7:deltaF311

外显子17:3171 delc

外显子7:1078解决

外显子17A:3199del6

外显子7:G330X

外显子17B:R1066C

外显子7:R334W

外显子17b: W1089X (TGG>TAG)

外显子7:T338I

外显子17b: Y1092X (C>G)

外显子7:R347P

外显子17b: Y1092X (C>A)

外显子7:R347H

外显子17 b: M1101K

外显子7:R352Q

外显子17 b: M1101R

外显子7:Q359K

18外显子:D1152H

外显子7:T360K

外显子19:R1158X

外显子8:1288英斯达

外显子19:R1162X

外显子9:A455E

外显子19:3659 delc

外显子10:S466X(C> A)

外显子19:3667 del4

外显子10:S466X (C>G)

外显子19:S1196X

外显子10:G480C

Exon 19: W1204X (TGG>TAG)

外显子10:Q493X

外显子19:3791 delc

外显子10:deltaI507

外显子19:Q1238X

外显子10:deltaF508

内含子19:3849+10kb C>T

外显子10:1677delTA

外显子20:3876delA

外显子10:C524X

外显子20:S1251N

内含子10:1717-1 G> A

外显子20:S1255X

外显子11:G542X

外显子20:3905本月

外显子11:S549N

外显子20:W1282X(TGG> TGA)

外显子11:S549R (T>G)

21外显子:4016本月

外显子11:G551D

外显子21:N1303K (C>A)

外显子11:Q552X

外显子21:N1303K(C> G)

看到囊性纤维化分子诊断检测算法参阅特别说明以了解更多信息。

参考值描述参考间隔和其他信息以解释测试结果。可能包括适当时基于年龄和性别的间隔。除非另有说明,否则间隔是梅奥衍生的。如果提供了解释性报告,则参考值字段将陈述这一点。

将提供一份解释性报告。

解释提供有助于解释测试结果的信息

将提供一份解释性报告。

注意事项讨论可能导致诊断混乱的条件,包括不适当的标本采集和处理,不适当的试验选择和干扰物质

本试验不能检测所有引起囊性纤维化的变异。因此,没有可检测到的变异并不排除个人是这种疾病的携带者或受其影响的可能性。

检测结果应结合临床表现、家族史和其他实验室数据进行解释。如果给出的信息不准确或不完整,对结果的解释就可能出现错误。

罕见的改变(即多态性)存在,可能导致假阴性或假阳性结果。如果得到的结果不符合临床发现,额外的测试应予以考虑。

在罕见的病例中,可以鉴定出意义不明的DNA改变。

临床参考深入阅读临床性质的建议

1.昆特A,我莱勒,史记男,Abeliovich d:犹太囊性纤维化患者基因突变谱在以色列:寓意于携带者筛查。上午医学遗传学杂志A. 2005; 136(3):246-248。DOI:10.1002 / ajmg.a.30823

2.Bobadilla JL, Macek M, Fine FP, Farrell PM:囊性纤维化的全球分析雌性生殖道突变与发病率数据的相关性及在筛查中的应用。哼Mutat。2002;19(6):575 - 606。doi: 10.1002 / humu.10041

3.休格曼EA,Rohlfs EM,西尔弗曼LM,Alitto BA:雌性生殖道美国西班牙裔和非洲裔个体间变异分布:评估囊性纤维化患者和携带者筛查人群。Genet Med。2004; 6(5):392-399。DOI:10.1097 / 01.gim.0000139503.22088.66

4.Watson MS, Cutting GR, Desnick RJ,等:囊性纤维化人群携带者筛查:美国医学学院遗传突变小组2004年修订。麝猫医学。2004;6(5):387 - 391。gim.0000139506.11694.7c doi: 10.1097/01.

5.Heim RA, Sugarman EA, Allitto BA:使用扩展的泛种族突变面板改进了美国杂合子人群囊性纤维化突变的检测。麝猫。2001;3(3):168 - 176。doi: 10.1097 / 00125817-200105000-00004

6.De Boeck K, Munck A, Walker S,等:ivacaftor在囊性纤维化和非g551d门控突变患者中的有效性和安全性。J囊肿纤维。2014年12月;13(6):674-680。doi: 10.1016 / j.jcf.2014.09.005

特殊说明PDF库包括与测试相关的相关信息和表格