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测试ID:ATNGS
抗凝血酶缺乏,serpinc1.基因,下一代测序变化

对...有用建议测试可能有用的临床障碍或设置

确定一种致病改变serpinc1.和临床上诊断抗凝血酶缺乏的个体抗凝血酶(AT)蛋白的受影响区域

缺乏诊断的临床遗传确认,特别是在活动水平下临界患者的患者

基于基因型 - 表型相关性的预后和风险评估

确定与个人有关的家庭成员的改变状态serpinc1.以通知临床管理和遗传咨询的目的改变

评估表观肝素抗性的个体

这个测试是不吃产前诊断

遗传学测试信息提供可能有助于选择正确的遗传测试或适当提交测试请求的信息

该测试检测到致病性改变serpinc1.基因在患者中描绘患者的潜在分子缺陷,基于活性或抗原的降低的抗凝血酶(AT)缺乏的实验室诊断。

该测试的基因靶标是:

基因名称(成绩单):serpinc1.(GRCH37 [HG19] NM_000488)

染色体位置:1Q25.1

测试算法在初始订单中添加测试时,描绘情况。这包括反射和额外的测试。

抗凝血酶缺乏症的临床疗效以抗凝血酶(AT)活性测定(参见ATTF /抗凝血酶活性,血浆)开始。异常结果被认为是正常活动的少于80%。

如果:

-AT活性测定小于80%

- 由于家庭历史或非典型临床介绍,为抗凝血酶的遗传性缺乏术临床怀疑

如果在活性结果是异常的话,通常进行抗凝血酶抗原测定以确定存在的抗凝血酶的数量(ATTI /抗凝血酶抗原,血浆)。这样做是为了区分I型缺乏(在活性和抗原降低)和缺乏的II型(低活性和正常抗原)。

临床信息讨论生理学,病理生理学和一般临床方面,因为它们与实验室测试有关

抗凝血酶(AT)缺乏是一种罕见的遗传性血栓性血栓性血栓性血栓性血栓性血栓性血栓栓塞的风险显着增加。在选定的病例中,患者表现出肝素抗性。缺乏缺陷的个体患静脉血栓栓塞(VTE)和晚期(第2或第3阵列)妊娠损失的风险增加。(1,2)据估计,缺乏遗传的个体具有16倍的vte风险增加与没有缺陷的人相比。(4)缺乏症的妇女在怀孕期间和交付后患凝块的风险特别高。(5)

遗传性在缺乏症是罕见的,在2000年的一般人群中的普及率为5000至5000人。(1,2)遗传性缺乏以常染色体显性的方式遗传,具有可变渗透。男女都可能受到影响。

缺乏是血浆中浓度或功能的缺陷的结果,血浆中的天然抗凝血剂。AT是通过灭活凝血酶和因子Xa来血液凝固的主要抑制剂。这serpinc1.基因编码抗凝血酶。基因检测serpinc1.表示在活性测定中的等离子体异常低(即,通常小于正常或低于当地实验室中建立的参考范围的80%)。在急性血栓形成或疾病期间不应进行活动测试,因为这些可能导致临时减少水平。同样地,在患者服用抗凝血剂(例如可能错误的水平)或口腔直接因子XA抑制剂(例如,罗昔茄南班,甲氧吩或eDoxaban)时,不应进行,这可能被错误地升高水平。

另外,缺乏缺乏症(非遗传)的原因比缺乏遗传程度更常见,并且在遗传测试之前应该被排除在外。这些在缺乏症中获得的原因包括肝病,急性血栓形成,肝素治疗,肾病综合征,传播血管内凝固,以及化学治疗剂这种L-天冬氨酸酶的影响。在遗传测试之前,应排除这些和其他获得的缺乏的原因。

参考值描述参考间隔和其他信息以解释测试结果。可能包括适当时基于年龄和性别的间隔。除非另有说明,否则间隔是梅奥衍生的。如果提供了解释性报告,则参考值字段将陈述这一点。

将提供一个解释性报告

解释提供有助于解释测试结果的信息

将提供解释性报告。

变异的评估和分类是使用最近发表的美国医学遗传学和基因组学(ACMG)建议作为指导方式进行的。基于已知的,预测或可能的致病性分类变体,并报告了细节其潜在或已知意义的解释性评论。

与梅奥诊所特殊凝血诊所,分子造血实验室和血栓性中心的咨询可用于DNA诊断案例。这在复杂的病例或诊断是非典型或不确定的情况下,这可能特别有用。

注意讨论可能导致诊断混淆的条件,包括不当的标本收集和处理,不适当的测试选择和干扰物质

临床:

一些个体可以具有未被执行的方法识别的突变。因此,不存在突变并不能消除抗凝血酶(AT)缺乏的可能性。该测定不区分种系和体细胞改变,特别是具有显着低于50%的变异等位基因频率(VAF)。测试结果应在临床调查结果,家族史和其他实验室数据的背景下解释。如果提供的信息不准确或不完整,则可能会出现对结果的误解。

技术限制:

下一代测序(NGS)可能无法检测所有类型的遗传变体。另外,可能存在稀有多态性,其可能导致假阴性或阳性结果。因此,测试结果应在抗凝血酶活性和抗原测量,临床发现,家族史和其他实验室数据的背景下解释。如果结果与临床发现不匹配,则考虑用于分析这些基因的替代方法,例如Sanger测序或大缺失/复制分析。如果提供的信息不准确或不完整,则可能会出现对结果的误解。

如果鉴定多种改变,则NGS无法区分在同一等位基因(“CIS”)中发现的改变,并且在不同等位基因上发现的改变(“在Trans”)。这种限制可能使诊断或分类复杂化,并对遗传和遗传咨询有影响。为了解决这些病例,分子结果必须与临床历史,活动和抗原测量以及家庭研究相关联。

除非报告或预测导致疾病,否则未报告在没有导致氨基酸替代的内含子或改变中的改变。可根据要求提供针对该患者的这些和常见的多态性。

重新分类变体政策:

此时,实验室没有标准做法,以系统地评估可能的致病变异或变异的致病性致病性,其意义是检测和报道的不确定意义。实验室鼓励医疗保健提供者随时与实验室联系,以了解特定变体的地位如何随时间变化。

临床参考深入阅读临床性质的建议

1. Patnaik MM,MOLL S:遗传性抗凝血酶缺乏:综述。2008年血友病; 14(6):1229-1239

2. Blajcchamn Ma,Austin Rc,Fernandez-Rachubinski F,等:血:1992; 80(9):2159-2171

3. Patnaik MM,Guenther J,Pruthi RK等:分子分析在遗传性抗凝血酶(AT)缺乏诊断和管理中的潜在作用。血2009; 114:2976(摘要)

4. DI Minno Mn,Ambrosino P,Ageno W等人:天然抗凝血剂缺乏和静脉血栓栓塞的风险:观察研究的荟萃分析。Thromb寄生2015; 135(5):923-932

5. RogenHofer N,Bohlmann Mk,Beber-Winkler P等:预防,管理和患有遗传性抗凝血酶缺乏的妇女不良妊娠结果的程度。Ann Hematol 2014; 93(3):385-392

6.卢森堡B,Delev D,Geisen C,等人:抗凝血酶缺乏的分子基础。Thromb寄氧化物2011; 105(4):635-646

特别说明PDF库包括与测试相关的相关信息和表格