测试ID: NCLGP
神经元蜡样脂褐质病(巴顿病)基因面板，变化

对异常生化或可疑神经元蜡样脂褐藻病(NCL)的电镜结果进行随访

建立NCL患者的分子诊断

识别已知与NCL相关的基因变异，允许对有风险的家庭成员进行预测性检测

该测试利用下一代测序检测与神经元蜡样脂褐质病(NCL/Batten Disease)相关的16个基因的单核苷酸和拷贝数变异:ATP13A2，CLN3，CLN5，CLN6，CLN8，CTSD，CTSF，CTSK，DNAJC5，入库单，KCTD7，MFSD8，PANK2，PPT1，SGSH，TPP1．有关更多细节，请参见方法描述。

致病变异的鉴定可能有助于NCL(巴顿病)的诊断、预后、临床管理、家族筛查和遗传咨询。

可能会考虑/建议进行额外的一级测试。有关更多信息，请参见咨询信息。

神经元蜡样脂褐质病(NCL)是一种溶酶体储存疾病，涉及脂质细胞处理缺陷。NCL的临床特征为癫痫、智力和运动能力下降以及失明。电子显微镜通常显示粒状渗透沉积物(GROD)、曲线轮廓(CVB)或指纹轮廓(FP)的特征积累。酶学检测可能显示棕榈酰蛋白硫酯酶1 (PPT1)、三肽基肽酶1 (TPP1)或组织蛋白酶D (CTSD)的缺陷。目前至少有14种基因上不同的形式。

发病年龄和临床特征可以是可变的，从先天性到成人发病。NCL是典型的常染色体隐性遗传，尽管有一种成人发病形式(ANCL;DNAJC5基因)已被证明是常染色体显性遗传。

将提供一份解释性报告。

根据美国医学遗传学和基因组学学院(ACMG)的建议，对所有检测到的变异进行评估。(1)根据已知、预测或可能的致病性对变异进行分类，并报告解释性评论，详细说明它们的潜在或已知意义。

临床相关性:

检测结果应结合临床表现、家族史和其他实验室数据进行解释。如果提供的信息不准确或不完整，可能会导致对结果的误解。

如果检查是由于有临床意义的家族史而进行的，那么首先检查受影响的家庭成员往往是有用的。在受影响的家庭成员中发现可报告的变异将有助于对危险个体进行更有信息的检测。

为了讨论进一步检测选项的可用性，为一般检测选择提供帮助，或为这些结果的解释提供帮助，可以联系梅奥诊所实验室的遗传顾问，电话800-533-1710。

技术的局限性:

下一代测序可能无法检测到所有类型的基因组变异。在极少数情况下，可能会出现假阴性或假阳性结果。对于某些靶区，覆盖深度可能是可变的，但检测性能低于最低可接受标准或失败区域将被注意到。鉴于这些局限性，阴性结果并不排除遗传疾病的诊断。如果怀疑有特定的临床疾病，可以考虑采用其他方法进行评估。

如果患者曾接受过异基因造血干细胞移植或最近的异体输血，这些结果可能由于捐献者DNA的存在而不准确。请致电梅奥yabo208诊所实验室，了解如何对接受骨髓移植的病人进行检测。

由于检测技术的限制，可能存在基因区域无法有效扩增用于测序或缺失和重复分析，包括同源区域、高鸟嘌呤-胞嘧啶(GC)含量和重复序列。根据内部实验室标准，采用替代方法对选定的可报告变型进行确认。

该方法不能可靠地检测40个或更多碱基对(bp)的插入/缺失(indels)，包括Alu插入、长核杂散元素(LINES)和短核杂散元素(SINES)。生物信息学软件管道被证实可以检测95%的75 bp以下的缺失和47 bp以下的插入。

此外，低水平的镶嵌变体可能无法检测到。

这个测试不是为了区分体细胞变异和种系变异。如果有可能任何检测到的变异是体细胞，可能需要额外的检测来澄清结果的重要性。

Variants-Policy重新分类:

目前，实验室定期系统地审查以前分类过的变种还不是标准做法。实验室鼓励卫生保健提供者随时与实验室联系，以了解某一特定变体的状态随时间的变化情况。

变体的评估:

变异的评估和分类采用美国医学遗传学和基因组学学院(ACMG)和分子病理学协会(AMP)的建议作为指导方针。其他基因特异性指南也可以考虑。变异是根据已知的、预测的或可能的致病性进行分类的，并以解释性注释详细说明其潜在的或已知的意义。分类为良性或可能良性的变异没有报告。

多种硅评价工具可用于帮助解释这些结果。硅评估工具预测的准确性高度依赖于给定基因的可用数据，定期更新这些工具可能会导致预测随着时间的推移而改变。从硅评估工具的结果应解释谨慎和专业的临床判断。未预测会影响剪接或导致疾病的内含子和同义序列变异尚未报道。

1.Richards S, Aziz N, Bale S，等:解释序列变异的标准和指南:美国医学遗传学和基因组学学院和分子病理学协会的联合共识建议。Genet Med. 2015 May;17(5):405-424

2.Mole SE, Cotman SL:神经元ceroid lipofuscinoses(巴顿病)的遗传学。Acta optica sinica . 2015; 37 (5): 593 - 598

3.Cooper JD, Tarczyluk MA, Nelvagal HR: NCL发病机制的新认识。Acta botanica sinica(云南植物研究与开发)，2015

4.神经元蜡样脂褐病的新命名和分类方案。神经学。2012;79 (2):183 - 191

5.Mole SE, Williams RE:神经元蜡样质脂褐藻病。见:Adam MP, Ardinger HH, Pagon RA等编。GeneReviews[网络]。华盛顿大学。西雅图;2001.2013年8月1日更新。2020年10月28日通过可以在www.ncbi.nlm.nih.gov /书/ NBK1428 /

• 分子遗传学:生化疾病患者信息
• 基因检测的知情同意
• 基因检测的知情同意(西班牙语)